More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3668 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 757 aa  1536    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  34.06 
 
 		 797 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  32.16 
 
 		 755 aa  330  6e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 797 aa  326  9e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 783 aa  320  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 741 aa  311  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  33.24 
 
 		 755 aa  300  7e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.57 
 
 		 730 aa  287  5e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 704 aa  278  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 803 aa  276  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 778 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 763 aa  267  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 722 aa  263  8e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 798 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 778 aa  257  5e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 790 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 800 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 800 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 790 aa  253  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 777 aa  253  8.000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.65 
 
 		 767 aa  250  8e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 769 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 749 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 779 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 786 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 814 aa  243  9e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 743 aa  243  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 788 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 784 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 736 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 763 aa  238  4e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 732 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.03 
 
 		 759 aa  236  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 785 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 713 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 734 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 737 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 720 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 808 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 722 aa  231  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 700 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 790 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 822 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 790 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 792 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 774 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 756 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 710 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 		 739 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 731 aa  223  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 733 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 743 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 771 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 713 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 782 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 730 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 755 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 803 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 753 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 741 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 796 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 758 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 788 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 751 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 817 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 840 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 796 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 763 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 769 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 783 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.48 
 
 		 695 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 764 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 835 aa  214  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 687 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.74 
 
 		 822 aa  213  1e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 824 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 726 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 838 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 743 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 790 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 766 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 726 aa  210  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 702 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 919 aa  209  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 903 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 777 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 735 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 761 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 794 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 764 aa  204  6e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 753 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  29.83 
 
 		 784 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 773 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.45 
 
 		 776 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>