More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1985 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 754 aa  1530    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 803 aa  296  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 733 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 809 aa  290  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.42 
 
 		 761 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 780 aa  277  4e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 741 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 755 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 704 aa  270  5e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 790 aa  267  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 761 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 825 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 747 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 780 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 710 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 785 aa  254  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 783 aa  254  6e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 728 aa  253  8.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  27.57 
 
 		 748 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 790 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 796 aa  247  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 751 aa  247  6e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 787 aa  247  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 759 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 730 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 780 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 723 aa  244  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 736 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 749 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 771 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 766 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 726 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 755 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 728 aa  236  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 744 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 792 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 775 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 769 aa  229  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 722 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 720 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 745 aa  227  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 764 aa  226  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 763 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.48 
 
 		 739 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 775 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 730 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 856 aa  222  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 794 aa  221  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.99 
 
 		 755 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 807 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 743 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 860 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 753 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.39 
 
 		 747 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 779 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  28.8 
 
 		 759 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 786 aa  218  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 725 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 724 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 734 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 780 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 771 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 804 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 771 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 763 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 774 aa  206  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.28 
 
 		 776 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 732 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 743 aa  204  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 808 aa  205  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 756 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 851 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 822 aa  203  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 729 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 758 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 853 aa  200  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 758 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 759 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 735 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 731 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 758 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 797 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 731 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 817 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 726 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 750 aa  196  9e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 776 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 761 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 758 aa  194  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 758 aa  194  7e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 758 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 732 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 817 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>