More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3870 on replicon NC_009426
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 726 aa  1478    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 730 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 717 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 726 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 771 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 722 aa  303  9e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 704 aa  287  4e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 741 aa  273  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 722 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 736 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 726 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 710 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.73 
 
 		 739 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 749 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 730 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  29.74 
 
 		 747 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 744 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 761 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 784 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 765 aa  225  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 750 aa  223  7e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 783 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.21 
 
 		 759 aa  221  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 769 aa  220  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 758 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 720 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 729 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 794 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 764 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 761 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 755 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 737 aa  214  5.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 728 aa  213  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 735 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 759 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 773 aa  211  4e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 763 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 776 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 758 aa  210  6e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 733 aa  210  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 758 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 758 aa  208  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 758 aa  209  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 773 aa  208  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 817 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 759 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 780 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 757 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 764 aa  206  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 779 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 766 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 773 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 758 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 743 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 753 aa  198  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.81 
 
 		 755 aa  198  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 700 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 743 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 779 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 747 aa  197  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 803 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 754 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 734 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 794 aa  191  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 790 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 746 aa  190  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 777 aa  190  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 774 aa  190  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 825 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 725 aa  188  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 763 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 780 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 802 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 741 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.95 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 731 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 730 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 786 aa  184  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 761 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 769 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 764 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 803 aa  183  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 808 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 771 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 773 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 774 aa  180  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 822 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 778 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 796 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 		 767 aa  177  6e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 783 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 873 aa  177  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>