More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0914 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 802 aa  1616    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  62.31 
 
 		 753 aa  933    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  44.24 
 
 		 771 aa  603  1.0000000000000001e-171  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 847 aa  421  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  33.08 
 
 		 763 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 742 aa  343  5e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  33.85 
 
 		 747 aa  318  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  32.69 
 
 		 784 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  33.91 
 
 		 822 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32.01 
 
 		 807 aa  302  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  31.65 
 
 		 785 aa  295  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  32.64 
 
 		 762 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 757 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  31.43 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  31.09 
 
 		 786 aa  289  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  33.02 
 
 		 752 aa  284  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  31.4 
 
 		 780 aa  277  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 780 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 781 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 808 aa  268  2.9999999999999995e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 777 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  29.98 
 
 		 806 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 792 aa  264  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 795 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 712 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 808 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 791 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 795 aa  256  9e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  30.81 
 
 		 889 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 777 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 875 aa  256  1.0000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 724 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 795 aa  251  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 766 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 766 aa  244  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 700 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 798 aa  226  1e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  28.98 
 
 		 715 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 764 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 802 aa  224  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 788 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 856 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.65 
 
 		 830 aa  218  5e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 797 aa  216  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 747 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  27.77 
 
 		 804 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 713 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 803 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 730 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 753 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 732 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 763 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 704 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 713 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 720 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 763 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 856 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.76 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 765 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 853 aa  197  6e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 846 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 710 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 851 aa  193  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 733 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 723 aa  191  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 767 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.59 
 
 		 739 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 883 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 759 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 790 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 780 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 783 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 763 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 904 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 785 aa  187  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 690 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 771 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 690 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 776 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 749 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 784 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 722 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 737 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 730 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 808 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 886 aa  179  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 687 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 726 aa  179  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 734 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 764 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 795 aa  177  8e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 775 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 757 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 731 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 854 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 726 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 731 aa  174  6.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>