More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2509 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 796 aa  1612    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 860 aa  301  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 919 aa  290  1e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 862 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 838 aa  267  5.999999999999999e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 903 aa  261  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 761 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 864 aa  260  9e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 730 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 815 aa  256  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 862 aa  253  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 808 aa  248  2e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 775 aa  247  6.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.62 
 
 		 839 aa  247  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 710 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.71 
 
 		 759 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 777 aa  240  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 726 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 779 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 730 aa  236  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 896 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 778 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 778 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 790 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 761 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 851 aa  222  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 758 aa  222  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 720 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 704 aa  221  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 784 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 848 aa  217  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 783 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 755 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 814 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 763 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 741 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 796 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 855 aa  210  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 787 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 743 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 790 aa  208  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 737 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  30.46 
 
 		 906 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 780 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 803 aa  202  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 832 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 741 aa  201  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 822 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 792 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 732 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 790 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 769 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.97 
 
 		 739 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 757 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 762 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 794 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.34 
 
 		 767 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 780 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 758 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 780 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 735 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 873 aa  193  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1518  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 854 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.388844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 765 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 807 aa  191  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 780 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.26 
 
 		 755 aa  190  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 717 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 741 aa  189  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  26.43 
 
 		 807 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 786 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 764 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 835 aa  188  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 764 aa  187  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 789 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 723 aa  187  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 880 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 713 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 773 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 695 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 755 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 806 aa  184  6e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 859 aa  184  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 731 aa  183  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 733 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 730 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 795 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 771 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 780 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 753 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 803 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 800 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 800 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>