More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4338 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  79.77 
 
 		 838 aa  1368    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 864 aa  1753    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  41.12 
 
 		 839 aa  592  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  38.3 
 
 		 919 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 862 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  32.15 
 
 		 906 aa  379  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 903 aa  375  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 896 aa  341  4e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 860 aa  300  5e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 862 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 815 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  30.65 
 
 		 808 aa  282  1e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 796 aa  264  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 880 aa  259  1e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 803 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 777 aa  251  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 767 aa  251  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 780 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 814 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 732 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 761 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 822 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 726 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 769 aa  233  2e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 763 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 797 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 778 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 710 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 730 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 776 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 873 aa  218  5e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 809 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 784 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 764 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 765 aa  214  7e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 783 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 810 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 747 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 730 aa  211  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 855 aa  211  6e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 783 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 848 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.56 
 
 		 722 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 780 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 780 aa  209  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 773 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 825 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 783 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 745 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 730 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 743 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 779 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 751 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 796 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_013132  Cpin_2250  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 851 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 803 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 741 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 867 aa  198  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 764 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 771 aa  196  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 797 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 784 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 762 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 824 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 761 aa  195  4e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 736 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 786 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 794 aa  194  8e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 794 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.54 
 
 		 776 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 767 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  32.1 
 
 		 778 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 798 aa  190  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0198  outer membrane receptor for iron transport  26.54 
 
 		 878 aa  189  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 773 aa  188  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 809 aa  187  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 790 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3141  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 815 aa  187  6e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 835 aa  187  7e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 780 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.23 
 
 		 715 aa  187  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 789 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 749 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 786 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 790 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 713 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 803 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 784 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24.78 
 
 		 829 aa  181  4e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 728 aa  181  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 785 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 722 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  42.86 
 
 		 720 aa  181  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>