More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5256 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 731 aa  1483    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 723 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.5 
 
 		 704 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 729 aa  279  1e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 730 aa  277  6e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 734 aa  266  8e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.6 
 
 		 710 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 736 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 722 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.31 
 
 		 739 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  30.84 
 
 		 741 aa  248  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 761 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 792 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 762 aa  245  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 747 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 758 aa  243  7e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 726 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 780 aa  239  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 765 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 749 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 783 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 790 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.24 
 
 		 759 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 722 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 775 aa  230  8e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 732 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.17 
 
 		 695 aa  228  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 776 aa  227  5.0000000000000005e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 753 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 794 aa  225  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 777 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 763 aa  224  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 744 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 743 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 775 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 726 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 780 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 771 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 751 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 720 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 730 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 738 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 780 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 730 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 817 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 789 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 757 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 766 aa  210  6e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 761 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 779 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.03 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 730 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 759 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 796 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 862 aa  206  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 788 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 764 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 761 aa  204  5e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 763 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 803 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 733 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 808 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 737 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.78 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 731 aa  201  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 780 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 771 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 746 aa  199  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 785 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  28.75 
 
 		 747 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 725 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 750 aa  197  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 741 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 743 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.95 
 
 		 754 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 755 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 794 aa  197  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 745 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 772 aa  195  3e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 728 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.1 
 
 		 755 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 794 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 713 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 769 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 764 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 771 aa  191  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 797 aa  191  5e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 812 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 728 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.17 
 
 		 733 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 773 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 779 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 796 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 769 aa  187  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 786 aa  187  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>