More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3103 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 725 aa  1468    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 763 aa  304  3.0000000000000004e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.96 
 
 		 759 aa  299  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 746 aa  288  2.9999999999999996e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.75 
 
 		 722 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 747 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 726 aa  273  6e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 771 aa  270  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 734 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 730 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 758 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 723 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 794 aa  248  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 732 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 764 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 726 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 743 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 753 aa  243  7.999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 704 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 761 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 737 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 720 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 773 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 722 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 761 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 731 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 773 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 730 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 771 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 783 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 741 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 773 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 764 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.63 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  30.25 
 
 		 767 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 766 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 748 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 		 779 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 769 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 743 aa  227  5.0000000000000005e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 785 aa  227  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 758 aa  224  4.9999999999999996e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 745 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 780 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 756 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 773 aa  220  6e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 786 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 743 aa  220  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 755 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 713 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 763 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.14 
 
 		 754 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 786 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 775 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 780 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 755 aa  213  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 792 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 780 aa  213  7.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 803 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.4 
 
 		 739 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 777 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 779 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 765 aa  210  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 730 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 771 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 728 aa  207  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 790 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 729 aa  206  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 733 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 775 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 757 aa  204  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 735 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 779 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 784 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 717 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 809 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 710 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 730 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 785 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 731 aa  200  9e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 776 aa  200  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 700 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 795 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.44 
 
 		 741 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 695 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 733 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.87 
 
 		 776 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  28.49 
 
 		 738 aa  197  5.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 744 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 808 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 749 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 754 aa  194  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.84 
 
 		 732 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 757 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 774 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 822 aa  194  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>