More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02728 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  100 
 
 		 738 aa  1501    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  52.15 
 
 		 757 aa  728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  45.67 
 
 		 754 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  45.22 
 
 		 731 aa  572  1.0000000000000001e-162  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  43.19 
 
 		 769 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  42.11 
 
 		 758 aa  568  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  43.63 
 
 		 742 aa  542  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  40.49 
 
 		 777 aa  538  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  40.76 
 
 		 761 aa  472  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  40.19 
 
 		 776 aa  461  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  40 
 
 		 763 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 773 aa  239  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 771 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 794 aa  228  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 747 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 773 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 763 aa  218  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 737 aa  217  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 782 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 759 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.52 
 
 		 755 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 741 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 761 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 743 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 773 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 725 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 723 aa  197  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 704 aa  190  9e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 778 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 778 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 766 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 730 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 748 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 743 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 726 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 758 aa  177  7e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 790 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 790 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 765 aa  174  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.82 
 
 		 754 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 729 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 767 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 764 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 710 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 787 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 759 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 735 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 800 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 800 aa  167  5e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 784 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 761 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 757 aa  167  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2110  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 765 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0914186  normal  0.510297 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 803 aa  164  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 733 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 786 aa  163  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 722 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 730 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 808 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  25.25 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 720 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 755 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 790 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 791 aa  160  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 746 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 798 aa  159  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 814 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 822 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 756 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 786 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 771 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 774 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 777 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 744 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 755 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 730 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 734 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 780 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 769 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 848 aa  149  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 779 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 758 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 728 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 780 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 761 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 767 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 758 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 717 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 795 aa  147  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 809 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 784 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  24.87 
 
 		 741 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 784 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>