More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1672 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  74.25 
 
 		 763 aa  1112    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  51.71 
 
 		 731 aa  712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  72.05 
 
 		 776 aa  1077    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 761 aa  1548    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  47.25 
 
 		 758 aa  639    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  45.95 
 
 		 742 aa  595  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  44.57 
 
 		 777 aa  593  1e-168  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  40.94 
 
 		 757 aa  497  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  39.92 
 
 		 769 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  41.17 
 
 		 738 aa  469  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  39.97 
 
 		 754 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.84 
 
 		 759 aa  270  8e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 763 aa  260  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 747 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 773 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 771 aa  246  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 773 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 725 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 704 aa  225  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 764 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 743 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 766 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 794 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.15 
 
 		 695 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 761 aa  208  3e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 761 aa  207  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 771 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 773 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 737 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 782 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 764 aa  200  7e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.97 
 
 		 755 aa  200  9e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 726 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 758 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 743 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.58 
 
 		 754 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 755 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 756 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 759 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  27.44 
 
 		 747 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 702 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 761 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 767 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 749 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 790 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 739 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 728 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 808 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 817 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 755 aa  187  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 713 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.13 
 
 		 733 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 741 aa  183  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 765 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 720 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 726 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 789 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 764 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 730 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 809 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 738 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 723 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 790 aa  177  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 722 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 780 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 789 aa  177  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 744 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 753 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 937 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 734 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 777 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 735 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 784 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 814 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 767 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 785 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 853 aa  175  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 825 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 790 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 710 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.51 
 
 		 789 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 795 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.33 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 802 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 851 aa  171  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.4 
 
 		 797 aa  171  5e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 733 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  27.22 
 
 		 822 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 797 aa  170  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 731 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 758 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 786 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 736 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 785 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 767 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.46 
 
 		 771 aa  167  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>