More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1691 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  64.28 
 
 		 737 aa  987    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 743 aa  1505    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  49.79 
 
 		 748 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  39.18 
 
 		 764 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 746 aa  355  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 763 aa  309  1.0000000000000001e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.49 
 
 		 795 aa  300  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 730 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 759 aa  280  9e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 704 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 771 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.68 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 785 aa  263  6.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 790 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  31.72 
 
 		 743 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  30.27 
 
 		 722 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 755 aa  260  7e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 783 aa  253  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 756 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 730 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 773 aa  250  8e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 822 aa  248  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 782 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 700 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 733 aa  244  5e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 754 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 785 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.48 
 
 		 775 aa  240  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 771 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 790 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 720 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 780 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 779 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 743 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 764 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 773 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 757 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 723 aa  233  1e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  27.8 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 758 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 794 aa  231  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 767 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 764 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 765 aa  231  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 753 aa  231  4e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 747 aa  230  8e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 757 aa  228  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 773 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 809 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 779 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 790 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 710 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 761 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 739 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 729 aa  227  7e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 784 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 784 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 734 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 789 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 759 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 767 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 733 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 857 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 730 aa  217  7e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 732 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 773 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 769 aa  216  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 758 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 758 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 758 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 758 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 796 aa  213  7.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 702 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 808 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 749 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 728 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.65 
 
 		 695 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 796 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 775 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 777 aa  210  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 794 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 755 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 731 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 744 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 722 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 717 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.67 
 
 		 754 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 771 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 757 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 713 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  27.28 
 
 		 738 aa  200  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 761 aa  197  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 784 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>