More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0989 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1569    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  40.41 
 
 		 776 aa  523  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  39.09 
 
 		 803 aa  484  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  36.5 
 
 		 860 aa  476  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  37.4 
 
 		 765 aa  465  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  35.93 
 
 		 867 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  36.76 
 
 		 755 aa  435  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 792 aa  434  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 790 aa  431  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 761 aa  424  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 780 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  34.11 
 
 		 851 aa  399  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  34.35 
 
 		 761 aa  392  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  35.16 
 
 		 807 aa  390  1e-107  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 790 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  35.92 
 
 		 832 aa  389  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 704 aa  344  4e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  33.72 
 
 		 749 aa  339  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 741 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  35.11 
 
 		 753 aa  334  4e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  33.91 
 
 		 710 aa  325  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  32.22 
 
 		 743 aa  313  7.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  33.29 
 
 		 759 aa  310  5.9999999999999995e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 804 aa  307  6e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 730 aa  305  2.0000000000000002e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 784 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 736 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 730 aa  303  8.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  32.62 
 
 		 775 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  31.85 
 
 		 796 aa  297  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.37 
 
 		 720 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 783 aa  295  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 792 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 856 aa  294  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 787 aa  293  7e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  31.48 
 
 		 779 aa  291  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 728 aa  292  2e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 784 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 745 aa  285  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 794 aa  284  4.0000000000000003e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 786 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 758 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 771 aa  283  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  31.42 
 
 		 729 aa  282  2e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 775 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 780 aa  282  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 758 aa  280  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 759 aa  278  3e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 785 aa  277  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 758 aa  276  7e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 817 aa  273  8.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 763 aa  272  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.57 
 
 		 739 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 723 aa  267  5e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 766 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 750 aa  264  4e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 734 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 733 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 732 aa  261  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.95 
 
 		 771 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 774 aa  258  2e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  29.06 
 
 		 754 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  29.47 
 
 		 807 aa  257  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 722 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  30.31 
 
 		 758 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 737 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 782 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 730 aa  245  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.24 
 
 		 751 aa  245  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 730 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3637  TonB-dependent receptor  29.35 
 
 		 858 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 777 aa  243  1e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  30.09 
 
 		 759 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 744 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 743 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 783 aa  240  5.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 773 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.35 
 
 		 731 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 722 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 797 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 751 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 764 aa  239  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 764 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 771 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.34 
 
 		 755 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 728 aa  239  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 779 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 859 aa  237  6e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 743 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 762 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 726 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  29.22 
 
 		 763 aa  234  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 853 aa  233  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 809 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.5 
 
 		 726 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 767 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 738 aa  231  5e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  27.97 
 
 		 741 aa  228  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>