More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4347 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  100 
 
 
795 aa  1605    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  56.01 
 
 
777 aa  813    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  35 
 
 
822 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  34.55 
 
 
784 aa  350  4e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
752 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  33.55 
 
 
777 aa  335  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 
734 aa  318  3e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  34.35 
 
 
856 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 
753 aa  276  8e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.86 
 
 
785 aa  264  6e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 
802 aa  252  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 
762 aa  251  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
763 aa  244  5e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 
712 aa  237  7e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.39 
 
 
771 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
795 aa  226  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
791 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 
786 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 
781 aa  213  9e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
806 aa  213  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
757 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 
766 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 
795 aa  204  7e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
780 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 
802 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
808 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
780 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
792 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.66 
 
 
889 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 
747 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 
797 aa  192  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
753 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 
766 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 
808 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
798 aa  185  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  29.82 
 
 
804 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
788 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 
794 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
807 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 
702 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
742 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.71 
 
 
755 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.41 
 
 
695 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
847 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 
755 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 
775 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 
704 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 
756 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 
851 aa  171  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 
774 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
720 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
853 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 
731 aa  168  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
761 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 
761 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
733 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
767 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 
771 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 
747 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
790 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
773 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 
829 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
792 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
725 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.05 
 
 
776 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 
773 aa  160  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 
761 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
763 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24 
 
 
846 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
724 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
829 aa  159  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
700 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
697 aa  156  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
790 aa  156  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
726 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 
784 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.41 
 
 
790 aa  155  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 
763 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 
779 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 
741 aa  153  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
734 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
761 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
764 aa  151  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  23.78 
 
 
904 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 
755 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 
776 aa  149  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 
730 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2505  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
747 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00363103  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
722 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 
729 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 
771 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  25.27 
 
 
801 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  29.21 
 
 
738 aa  146  2e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
732 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 
780 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 
808 aa  145  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
745 aa  145  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 
797 aa  145  3e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 
713 aa  145  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
763 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>