More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2647 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 847 aa  1712    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  40.22 
 
 		 771 aa  513  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 		 753 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 802 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.11 
 
 		 856 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 763 aa  247  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.07 
 
 		 822 aa  239  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 804 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 742 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 752 aa  218  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.43 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 734 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 788 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 792 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  27.61 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 780 aa  195  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 798 aa  191  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 780 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 781 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 795 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 757 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 766 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 786 aa  180  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 795 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.71 
 
 		 829 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 795 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 762 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 		 889 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 797 aa  173  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 747 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 802 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 808 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 791 aa  168  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 712 aa  167  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 785 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 704 aa  153  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 806 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.79 
 
 		 739 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 771 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 904 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  23.89 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 770 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 713 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 724 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 853 aa  141  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 756 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 713 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 753 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 851 aa  139  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 785 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 883 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 723 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 730 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  24.59 
 
 		 830 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 737 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 687 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 795 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 734 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 732 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 695 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 809 aa  130  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.78 
 
 		 685 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 730 aa  127  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 720 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 796 aa  121  3.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 764 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 743 aa  121  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  30.9 
 
 		 365 aa  120  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 886 aa  119  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 794 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  33.47 
 
 		 829 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 731 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 761 aa  118  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 829 aa  117  7.999999999999999e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 875 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.58 
 
 		 755 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 747 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 709 aa  116  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 773 aa  114  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 767 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.69 
 
 		 776 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 703 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 		 790 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 762 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 		 808 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  21.88 
 
 		 732 aa  110  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  22.48 
 
 		 846 aa  110  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 773 aa  109  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 929 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  23.64 
 
 		 744 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 759 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 759 aa  108  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 782 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 743 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 726 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>