More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2711 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 766 aa  1551    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  69.63 
 
 		 365 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4007  TonB-dependent receptor  54.5 
 
 		 389 aa  416  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 753 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  30.64 
 
 		 822 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 802 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  30.08 
 
 		 856 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 734 aa  240  5.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 780 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.42 
 
 		 771 aa  234  4.0000000000000004e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 752 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 780 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 791 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 742 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.93 
 
 		 785 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 781 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 747 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 777 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 786 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.15 
 
 		 737 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  30.43 
 
 		 889 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 757 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 795 aa  209  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 712 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.99 
 
 		 724 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.3 
 
 		 784 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 795 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 777 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 792 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 798 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 775 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 795 aa  188  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  28.52 
 
 		 829 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 807 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 743 aa  184  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  30.68 
 
 		 853 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 851 aa  182  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 847 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 778 aa  180  9e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 808 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 806 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.67 
 
 		 695 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 709 aa  177  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 729 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 778 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 753 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 720 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 723 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 883 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 702 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 802 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 796 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 797 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  26.59 
 
 		 776 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 731 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 797 aa  163  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 903 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 785 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 803 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 763 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 761 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 788 aa  160  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 790 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 732 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 875 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 761 aa  157  6e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 713 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 785 aa  157  7e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 786 aa  157  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.89 
 
 		 759 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 825 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 783 aa  155  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 774 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 710 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 794 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 808 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 784 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 762 aa  153  8.999999999999999e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 746 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 780 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 763 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  25.94 
 
 		 801 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 904 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 800 aa  151  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 800 aa  151  5e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 730 aa  151  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 796 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 777 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.78 
 
 		 767 aa  150  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 765 aa  150  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 713 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 790 aa  149  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 809 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 726 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>