More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4738 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 756 aa  1478    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  35.73 
 
 		 804 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  35.14 
 
 		 829 aa  330  5.0000000000000004e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  34.31 
 
 		 770 aa  326  9e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  35.1 
 
 		 801 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 829 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 795 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 747 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 753 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.3 
 
 		 856 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 795 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 792 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 763 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 802 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 786 aa  157  7e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 795 aa  156  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26.54 
 
 		 785 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.45 
 
 		 822 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 806 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 808 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 712 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 777 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 752 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 734 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 784 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 847 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 781 aa  133  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 777 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 766 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  31.73 
 
 		 771 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 791 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 742 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  28.4 
 
 		 365 aa  121  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 687 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 802 aa  119  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.73 
 
 		 889 aa  118  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 776 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 797 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 762 aa  114  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 883 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26 
 
 		 695 aa  112  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 904 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 808 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 737 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 753 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  36.45 
 
 		 886 aa  105  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 702 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 875 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 709 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 717 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 751 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 731 aa  101  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  23.19 
 
 		 798 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 724 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  31.51 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 666 aa  99  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 726 aa  97.4  9e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 747 aa  97.4  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 704 aa  97.1  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 749 aa  96.7  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  24.24 
 
 		 729 aa  94.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 695 aa  93.6  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 794 aa  94  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 731 aa  93.2  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0393  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 670 aa  92.8  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.431607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 773 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 732 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 726 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  27.69 
 
 		 829 aa  91.3  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 771 aa  91.3  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.86 
 
 		 755 aa  90.5  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 773 aa  90.1  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 734 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 725 aa  90.1  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 763 aa  90.5  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 688 aa  90.1  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 789 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0007  TonB-dependent receptor  20.58 
 
 		 641 aa  89  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 		 730 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  31.02 
 
 		 737 aa  88.2  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 862 aa  88.2  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  24.06 
 
 		 691 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.8 
 
 		 832 aa  88.2  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.3 
 
 		 741 aa  87.8  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 680 aa  87.4  8e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 775 aa  87  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 761 aa  87  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 729 aa  87  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 767 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 780 aa  85.9  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1794  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 744 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000583553  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 712 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 		 743 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 732 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  33.18 
 
 		 743 aa  85.5  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>