More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0535 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  49.76 
 
 		 792 aa  784    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  55.27 
 
 		 875 aa  897    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 808 aa  1660    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  48.3 
 
 		 795 aa  720    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  34.96 
 
 		 904 aa  446  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  29.9 
 
 		 846 aa  342  2e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 883 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 886 aa  303  8.000000000000001e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 757 aa  268  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 802 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.68 
 
 		 822 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 753 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 734 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 742 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 784 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 771 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 786 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 807 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 762 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 795 aa  226  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.48 
 
 		 785 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 752 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 791 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 806 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 763 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 802 aa  203  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 795 aa  198  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 780 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.08 
 
 		 856 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 712 aa  193  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 777 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 797 aa  189  1e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 777 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 763 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.81 
 
 		 889 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 720 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 766 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 781 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 773 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 795 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 724 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 798 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 808 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 847 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 792 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 775 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 803 aa  166  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 788 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 730 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 790 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 732 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 784 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 734 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 790 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 735 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 780 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 767 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 731 aa  158  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 809 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 766 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 747 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 797 aa  155  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 809 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 790 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 764 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  24.27 
 
 		 804 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 790 aa  152  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 785 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 829 aa  150  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 704 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.29 
 
 		 830 aa  149  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 723 aa  148  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 763 aa  146  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 758 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 807 aa  145  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 730 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 775 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 851 aa  143  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 853 aa  143  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 755 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 732 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 737 aa  141  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 739 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.94 
 
 		 759 aa  141  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 771 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 814 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 690 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 769 aa  139  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 743 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 713 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 808 aa  137  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 690 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>