More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3168 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  44.8 
 
 		 875 aa  700    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 795 aa  1632    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  50.38 
 
 		 792 aa  798    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  48.3 
 
 		 808 aa  720    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 904 aa  387  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  32.13 
 
 		 846 aa  346  1e-93  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 883 aa  305  3.0000000000000004e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 886 aa  271  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 753 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 734 aa  263  8.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 802 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 786 aa  248  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.34 
 
 		 822 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 771 aa  238  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 785 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 784 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 742 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 795 aa  225  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 757 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 777 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 763 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 777 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 807 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 791 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 806 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 795 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 752 aa  213  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 762 aa  207  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.03 
 
 		 856 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 780 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 780 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 712 aa  198  4.0000000000000005e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 788 aa  195  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 802 aa  194  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 747 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  25.74 
 
 		 804 aa  191  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 781 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.42 
 
 		 830 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 766 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 797 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 847 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 798 aa  182  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  25.36 
 
 		 889 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 777 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 790 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 756 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 731 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 792 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 730 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 720 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 775 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 780 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 753 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 797 aa  150  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 763 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 809 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 795 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 732 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 790 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 757 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 730 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 732 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 703 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 704 aa  145  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 747 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 784 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 728 aa  144  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 763 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 783 aa  142  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 743 aa  142  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 764 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 767 aa  141  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  23.54 
 
 		 829 aa  140  7e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 722 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 776 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 737 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 717 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 801 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 797 aa  137  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 782 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 724 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.14 
 
 		 759 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.29 
 
 		 755 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 734 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 767 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 735 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  23.46 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 807 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  22.8 
 
 		 769 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 790 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 759 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 761 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 722 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 733 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  24.22 
 
 		 748 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>