More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3471 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  62.56 
 
 		 798 aa  981    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 788 aa  1597    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  43.22 
 
 		 830 aa  622  1e-177  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 808 aa  500  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 771 aa  247  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 802 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 753 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 792 aa  207  7e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 785 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 847 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 807 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  27.43 
 
 		 856 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 777 aa  198  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 780 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 802 aa  196  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 742 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 795 aa  195  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 763 aa  194  4e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 777 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 734 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 762 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 		 889 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 795 aa  185  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 757 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 781 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 797 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 786 aa  178  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 791 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 780 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 747 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  26.14 
 
 		 784 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 703 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 752 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 712 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 806 aa  167  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 753 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 808 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 795 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 783 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  26.12 
 
 		 822 aa  163  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 766 aa  161  6e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 875 aa  158  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 704 aa  154  7e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 809 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 722 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 761 aa  147  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.87 
 
 		 715 aa  146  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 774 aa  145  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 766 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 846 aa  144  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.9 
 
 		 755 aa  144  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 904 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 729 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 780 aa  142  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  24.21 
 
 		 758 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 744 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 731 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 790 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 765 aa  138  5e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 759 aa  138  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 764 aa  137  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 722 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 724 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 792 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 883 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 733 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 790 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 785 aa  135  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 808 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 747 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 728 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.99 
 
 		 783 aa  132  2.0000000000000002e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.98 
 
 		 739 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 758 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 723 aa  131  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 741 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 718 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 777 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 757 aa  130  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 797 aa  129  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 745 aa  129  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 769 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 687 aa  129  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 784 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 758 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 800 aa  128  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 800 aa  128  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 764 aa  127  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  23.95 
 
 		 767 aa  127  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 754 aa  127  6e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 767 aa  127  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25 
 
 		 685 aa  127  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 771 aa  127  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 748 aa  127  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 776 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 757 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>