More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0686 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  57.5 
 
 
795 aa  808    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  100 
 
 
777 aa  1569    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  35.65 
 
 
822 aa  346  8e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  33.43 
 
 
752 aa  337  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  31.48 
 
 
784 aa  312  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  33.29 
 
 
856 aa  311  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 
777 aa  309  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  30.64 
 
 
734 aa  299  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 
753 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 
771 aa  271  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  30.86 
 
 
762 aa  263  8.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 
802 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  28.67 
 
 
785 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 
763 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
747 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 
795 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 
712 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 
757 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
807 aa  214  5.999999999999999e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
766 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.83 
 
 
889 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
875 aa  201  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 
802 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 
788 aa  198  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 
795 aa  197  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
786 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
766 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 
742 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 
797 aa  190  8e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
781 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
780 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 
808 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 
791 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 
780 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 
806 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 
775 aa  180  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
808 aa  180  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 
798 aa  177  9e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 
804 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 
755 aa  170  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
774 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 
732 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
720 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.82 
 
 
695 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 
722 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 
779 aa  164  7e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 
733 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 
704 aa  157  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27 
 
 
724 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
763 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 
784 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
794 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
761 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 
731 aa  154  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.41 
 
 
715 aa  152  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 
753 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
771 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
776 aa  150  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
761 aa  150  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
713 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 
829 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 
730 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 
702 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 
771 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.07 
 
 
739 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.9 
 
 
755 aa  147  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
730 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 
790 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 
764 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
725 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
883 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 
763 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
773 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
745 aa  144  6e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 
796 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 
703 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
800 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
800 aa  143  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
720 aa  142  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
773 aa  141  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 
776 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
771 aa  140  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 
734 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
853 aa  140  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
851 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 
751 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
761 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25 
 
 
761 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 
790 aa  138  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 
730 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 
767 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 
792 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  25.62 
 
 
673 aa  137  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 
786 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  25 
 
 
829 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  23.58 
 
 
731 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  25 
 
 
713 aa  135  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>