More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4114 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 703 aa  1430    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 732 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 695 aa  317  6e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  32.66 
 
 		 718 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 685 aa  284  4.0000000000000003e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  31.1 
 
 		 733 aa  276  9e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 713 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 713 aa  257  5e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 700 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 729 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 702 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 767 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 762 aa  223  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 783 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 690 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.96 
 
 		 715 aa  203  9e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 737 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 690 aa  199  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 704 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 724 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 761 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 720 aa  196  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 734 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 730 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 774 aa  187  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 732 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.02 
 
 		 759 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 844 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 766 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 792 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 720 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 747 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 784 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 776 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 695 aa  178  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 731 aa  177  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 769 aa  177  8e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2711  TonB-dependent receptor, plug  25.8 
 
 		 762 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.882237  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 788 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.77 
 
 		 755 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 853 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 730 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 803 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 765 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 777 aa  173  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 758 aa  172  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 761 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 764 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 851 aa  171  5e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 737 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 761 aa  169  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 798 aa  169  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 726 aa  168  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.17 
 
 		 739 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 712 aa  165  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 783 aa  164  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 783 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.48 
 
 		 839 aa  164  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 728 aa  164  7e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 753 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 758 aa  163  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 779 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 771 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 710 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 780 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 773 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 757 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 731 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 763 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 722 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 780 aa  157  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 792 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 750 aa  157  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 755 aa  157  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 783 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 777 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.8 
 
 		 797 aa  156  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 790 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 769 aa  155  2e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 754 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  23.55 
 
 		 779 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 723 aa  155  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 738 aa  155  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 802 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 743 aa  154  5e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 741 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 781 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 744 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 780 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 775 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>