More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2420 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 777 aa  1568    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  39.9 
 
 		 734 aa  461  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  35.29 
 
 		 822 aa  392  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  35.19 
 
 		 784 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  33.96 
 
 		 856 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 795 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 777 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 752 aa  296  8e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 753 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 		 771 aa  280  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 802 aa  267  5e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 786 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 763 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 795 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  27.42 
 
 		 785 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 795 aa  212  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 778 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 807 aa  204  4e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 762 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 778 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 792 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 712 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 732 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 808 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 847 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 742 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 781 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 806 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 766 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 747 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 791 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 757 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 808 aa  194  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 788 aa  193  8e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 803 aa  193  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.24 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 798 aa  191  4e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 720 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 763 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 780 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 802 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 751 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 726 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  26.21 
 
 		 889 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  25.61 
 
 		 830 aa  177  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 774 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 724 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 755 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 713 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 790 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 723 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 753 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 729 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 734 aa  167  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 786 aa  167  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 757 aa  167  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 784 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 780 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 797 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 753 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 790 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 743 aa  164  8.000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 794 aa  163  9e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 796 aa  163  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 790 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 730 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 769 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 730 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 761 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 785 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 777 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 775 aa  159  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 722 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 792 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 700 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 803 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 800 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.46 
 
 		 800 aa  156  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 780 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 780 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 769 aa  154  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 710 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 717 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 780 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 784 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 755 aa  153  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 704 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 919 aa  152  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 731 aa  152  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 776 aa  151  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  25.33 
 
 		 846 aa  151  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 757 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 746 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 702 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 785 aa  150  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>