More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03368 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  100 
 
 		 754 aa  1530    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  39.64 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 761 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 759 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 750 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 745 aa  220  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 803 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 758 aa  210  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 758 aa  210  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 		 774 aa  208  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 792 aa  207  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 758 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 765 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 704 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.78 
 
 		 770 aa  204  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 758 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 792 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 776 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 761 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 775 aa  195  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 780 aa  194  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.96 
 
 		 741 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 729 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 790 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 777 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  26.95 
 
 		 799 aa  188  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 783 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 722 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 764 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 728 aa  183  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 753 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 723 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 780 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 720 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 746 aa  177  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 786 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 790 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 783 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  27.66 
 
 		 759 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 755 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 771 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 784 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 856 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 732 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  31.37 
 
 		 832 aa  168  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 796 aa  167  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 771 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 749 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 771 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 728 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 762 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 784 aa  163  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 817 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 773 aa  163  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 726 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 726 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.13 
 
 		 797 aa  161  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 806 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 763 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  36.94 
 
 		 859 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 710 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  26.53 
 
 		 747 aa  157  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 747 aa  157  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 717 aa  157  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 779 aa  157  9e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  25.42 
 
 		 763 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 773 aa  156  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  37.87 
 
 		 851 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 766 aa  156  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.5 
 
 		 739 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 807 aa  154  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 779 aa  154  7e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 780 aa  153  8.999999999999999e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 777 aa  153  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 736 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  38.93 
 
 		 860 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 730 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.52 
 
 		 809 aa  152  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 790 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  28.36 
 
 		 797 aa  151  4e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 787 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 764 aa  150  8e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.25 
 
 		 755 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 785 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 730 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 794 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.67 
 
 		 715 aa  148  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 732 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 730 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 769 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 867 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 782 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 880 aa  146  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 780 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 784 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>