More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0767 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  68.95 
 
 		 886 aa  1233    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 883 aa  1787    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  37.56 
 
 		 846 aa  527  1e-148  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 792 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 875 aa  321  3.9999999999999996e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 808 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 		 795 aa  305  3.0000000000000004e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 904 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 763 aa  225  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  25.19 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 802 aa  208  4e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 807 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 797 aa  201  5e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 795 aa  192  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 742 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 802 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 753 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  24.21 
 
 		 785 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  24.86 
 
 		 786 aa  165  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 777 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 766 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 752 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 747 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  22.96 
 
 		 822 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 806 aa  153  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 763 aa  153  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 809 aa  152  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 780 aa  151  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 734 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 761 aa  147  6e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 777 aa  146  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 792 aa  144  7e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 791 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 889 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 794 aa  139  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 847 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 788 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  21.5 
 
 		 784 aa  135  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 792 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 780 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  23.6 
 
 		 765 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  21.13 
 
 		 804 aa  130  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 731 aa  130  1.0000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 712 aa  127  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 755 aa  127  8.000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 769 aa  127  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  23.59 
 
 		 718 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 743 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  23.32 
 
 		 795 aa  125  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  23.4 
 
 		 785 aa  125  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  23.36 
 
 		 753 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 779 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 		 763 aa  122  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 759 aa  121  7e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  35.84 
 
 		 971 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 822 aa  119  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 780 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  23.1 
 
 		 737 aa  117  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 777 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  22.54 
 
 		 829 aa  117  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 744 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 808 aa  114  9e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 365 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 969 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 729 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  36.22 
 
 		 856 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 781 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 783 aa  108  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  34.26 
 
 		 797 aa  108  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  33.77 
 
 		 784 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4007  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 389 aa  108  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.413023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  35.04 
 
 		 774 aa  108  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 756 aa  106  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  35.75 
 
 		 762 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 764 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  34.59 
 
 		 779 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  32.88 
 
 		 776 aa  105  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  33.48 
 
 		 839 aa  103  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 772 aa  103  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  32.34 
 
 		 777 aa  103  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 790 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  31.78 
 
 		 862 aa  102  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  33.01 
 
 		 797 aa  101  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  36.68 
 
 		 856 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  36.44 
 
 		 758 aa  101  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 723 aa  101  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  31.78 
 
 		 720 aa  101  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 717 aa  100  9e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 757 aa  100  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 790 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 754 aa  99.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  29.61 
 
 		 777 aa  98.6  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  31.28 
 
 		 862 aa  98.6  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 803 aa  98.2  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 720 aa  98.2  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 800 aa  98.6  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 800 aa  98.6  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  36.61 
 
 		 728 aa  97.8  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  31.05 
 
 		 801 aa  97.8  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>