More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2060 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 781 aa  1585    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  46.71 
 
 		 791 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  86.04 
 
 		 780 aa  1385    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  84.76 
 
 		 780 aa  1366    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  42.65 
 
 		 889 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  32.91 
 
 		 785 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 807 aa  300  5e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  32.27 
 
 		 757 aa  289  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 802 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 762 aa  268  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.44 
 
 		 753 aa  257  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  31.45 
 
 		 784 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.37 
 
 		 771 aa  245  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 		 747 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 786 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 763 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 795 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 766 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  28.87 
 
 		 822 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 734 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 795 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 752 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 802 aa  209  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 806 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 797 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 712 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 904 aa  196  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 777 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 792 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 798 aa  190  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 777 aa  190  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 795 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  29.27 
 
 		 742 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 847 aa  185  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 788 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 753 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.69 
 
 		 856 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 763 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 724 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 808 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 808 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 792 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 830 aa  168  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 853 aa  165  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 704 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 851 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 875 aa  161  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 702 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 790 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 790 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 774 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 703 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 794 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 769 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.89 
 
 		 695 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 761 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 730 aa  149  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 733 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  37.55 
 
 		 365 aa  147  6e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 720 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 739 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 765 aa  144  7e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.26 
 
 		 776 aa  144  9e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 775 aa  143  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 729 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 763 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 803 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 751 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 766 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 720 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 700 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.2 
 
 		 748 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 		 749 aa  138  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 796 aa  137  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 769 aa  137  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 773 aa  136  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 767 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.15 
 
 		 846 aa  135  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.3 
 
 		 715 aa  134  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 804 aa  134  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 784 aa  134  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 775 aa  134  9e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 804 aa  133  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 832 aa  132  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 726 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 780 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 730 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 		 725 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 756 aa  131  6e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 796 aa  130  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 695 aa  130  9.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 666 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 732 aa  130  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 764 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 713 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 795 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 771 aa  128  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 710 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>