More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4125 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 751 aa  1514    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  38.44 
 
 		 724 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  33.81 
 
 		 732 aa  338  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  31.59 
 
 		 732 aa  292  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 713 aa  275  3e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 720 aa  266  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 730 aa  262  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 790 aa  257  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 704 aa  257  5e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 		 702 aa  257  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 730 aa  256  9e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  31.96 
 
 		 794 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 710 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 729 aa  251  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 755 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 780 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 741 aa  246  9e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 		 777 aa  246  9.999999999999999e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 785 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.46 
 
 		 739 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 778 aa  244  6e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 766 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 803 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.91 
 
 		 715 aa  242  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 761 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 771 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.25 
 
 		 754 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 734 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  30.6 
 
 		 767 aa  239  1e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 790 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.86 
 
 		 700 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  28.65 
 
 		 761 aa  237  7e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 764 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 787 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 753 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  28.37 
 
 		 695 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.32 
 
 		 808 aa  235  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 762 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 761 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 780 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 773 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 790 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 792 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 784 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 763 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 803 aa  229  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 790 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 753 aa  229  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 773 aa  228  4e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 767 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 797 aa  226  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 767 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 783 aa  225  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 728 aa  224  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 778 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 728 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 788 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 786 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 685 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 763 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 		 723 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 744 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 764 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 822 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  27.29 
 
 		 755 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 804 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 731 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 747 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 736 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 759 aa  214  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 703 aa  213  7e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.32 
 
 		 809 aa  213  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 756 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 774 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 726 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 785 aa  211  5e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 717 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 733 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 771 aa  210  9e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.13 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 722 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 807 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 690 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 790 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 734 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 731 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 		 786 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 838 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 741 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 726 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 690 aa  206  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 783 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 856 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 769 aa  206  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>