More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4085 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 685 aa  1390    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 695 aa  331  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  32 
 
 		 713 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  33.05 
 
 		 718 aa  306  7e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 713 aa  296  7e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  32.93 
 
 		 733 aa  293  5e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  31.65 
 
 		 700 aa  291  4e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 702 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 703 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 		 732 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 767 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 737 aa  260  5.0000000000000005e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 751 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 755 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 695 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 818 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.43 
 
 		 715 aa  188  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 720 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 720 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 763 aa  183  9.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.01 
 
 		 734 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.03 
 
 		 748 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 710 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 753 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 784 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 853 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 720 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 732 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 746 aa  174  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 780 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 666 aa  172  3e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 717 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 747 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 730 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 851 aa  169  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 761 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 		 769 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 756 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 775 aa  165  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 774 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 794 aa  162  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 724 aa  161  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 743 aa  160  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.13 
 
 		 759 aa  160  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 726 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 790 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 766 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 737 aa  158  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 763 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.96 
 
 		 739 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 730 aa  157  9e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 758 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27.34 
 
 		 691 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.48 
 
 		 758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.69 
 
 		 755 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 704 aa  154  4e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 787 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 783 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 687 aa  153  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  25.51 
 
 		 747 aa  151  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 733 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 730 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 790 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 773 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 764 aa  151  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 790 aa  150  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 758 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 761 aa  150  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 710 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 722 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 744 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 741 aa  147  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 726 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 730 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 758 aa  147  7.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 728 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 762 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 797 aa  146  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.39 
 
 		 771 aa  146  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 723 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 767 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 764 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 803 aa  144  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 732 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  24.7 
 
 		 685 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 773 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 763 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 729 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 796 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 722 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 808 aa  139  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 903 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 780 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 731 aa  139  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 757 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 712 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>