More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2033 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1066  TonB-dependent receptor  47.54 
 
 
844 aa  762    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308413  normal  0.134897 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  49.88 
 
 
841 aa  792    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  100 
 
 
818 aa  1669    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
737 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  30.42 
 
 
767 aa  291  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 
700 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.19 
 
 
695 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
732 aa  264  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.27 
 
 
733 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 
702 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
718 aa  193  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 
713 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
685 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
720 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  24.15 
 
 
759 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 
703 aa  172  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
763 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.29 
 
 
792 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 
726 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
784 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 
734 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25 
 
 
751 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
802 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
710 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
724 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.28 
 
 
784 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 
764 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 
775 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 
730 aa  148  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
807 aa  147  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 
780 aa  146  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
756 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
732 aa  145  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 
775 aa  144  8e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
903 aa  143  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 
722 aa  143  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 
783 aa  142  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0535  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 
853 aa  141  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.445687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  24.04 
 
 
739 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 
843 aa  141  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 
773 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
896 aa  140  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 
779 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 
840 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  23.43 
 
 
757 aa  139  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
753 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
730 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 
723 aa  137  6.0000000000000005e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
789 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 
743 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 
776 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
767 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 
731 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 
764 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 
783 aa  134  7.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
713 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 
795 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 
779 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 
741 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  24.25 
 
 
717 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 
776 aa  131  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 
763 aa  130  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 
783 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
853 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 
766 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  31.08 
 
 
919 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  24.45 
 
 
822 aa  129  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  22.89 
 
 
851 aa  128  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 
786 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
712 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 
771 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23 
 
 
722 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  23.63 
 
 
780 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  23.68 
 
 
797 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
688 aa  123  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 
808 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 
825 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 
728 aa  118  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 
806 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 
824 aa  117  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 
757 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
759 aa  117  8.999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
752 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 
779 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 
758 aa  116  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 
822 aa  117  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  23.84 
 
 
789 aa  116  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  22.37 
 
 
748 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 
771 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  36.03 
 
 
790 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  22.82 
 
 
790 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 
773 aa  113  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 
720 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 
733 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 
766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
764 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 
747 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  21.52 
 
 
680 aa  112  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 
782 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  22.28 
 
 
684 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>