More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0190 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 710 aa  1446    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.5 
 
 		 695 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1427  TonB-dependent receptor  30.13 
 
 		 713 aa  223  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2440  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 688 aa  211  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0489256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 713 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 710 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 704 aa  189  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 720 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 853 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 684 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 851 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.77 
 
 		 715 aa  180  8e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 736 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 733 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 728 aa  177  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.13 
 
 		 755 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 680 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 687 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 761 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 767 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 732 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 697 aa  169  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 762 aa  169  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 731 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 763 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 755 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 753 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 713 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  27 
 
 		 691 aa  162  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  26.74 
 
 		 729 aa  160  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 730 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 720 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 766 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 732 aa  158  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 649 aa  156  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 736 aa  156  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 712 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 712 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.82 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 724 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 743 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 737 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 748 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 685 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.57 
 
 		 733 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 769 aa  152  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 757 aa  151  4e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 690 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 775 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 741 aa  150  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 713 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 690 aa  149  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 733 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 751 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 749 aa  148  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 780 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 730 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 783 aa  147  9e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 765 aa  146  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 790 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.22 
 
 		 764 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.3 
 
 		 755 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 790 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  25.77 
 
 		 751 aa  144  7e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 795 aa  144  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 730 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 777 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 758 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 725 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 794 aa  142  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 786 aa  142  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  26.51 
 
 		 732 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 764 aa  141  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 838 aa  141  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 700 aa  140  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 		 703 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 767 aa  140  7e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 741 aa  140  8.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 775 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  25.93 
 
 		 739 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 817 aa  138  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 776 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 729 aa  137  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0067  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 726 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 798 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 		 735 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 777 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 787 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 783 aa  134  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 728 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 722 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 761 aa  134  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>