More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1600 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  100 
 
 		 715 aa  1474    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 853 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 851 aa  303  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  32.05 
 
 		 687 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 		 720 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  29.96 
 
 		 695 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 720 aa  281  2e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 724 aa  278  2e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  30.69 
 
 		 695 aa  275  3e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 690 aa  266  7e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 713 aa  265  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 690 aa  265  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 747 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 730 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  30.17 
 
 		 702 aa  249  1e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4030  TonB-dependent receptor  29.58 
 
 		 732 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.667101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 733 aa  246  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 704 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 710 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 751 aa  241  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2605  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.67 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 775 aa  237  5.0000000000000005e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 734 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 700 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 723 aa  231  3e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 765 aa  230  6e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 761 aa  230  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 771 aa  230  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 732 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 736 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 803 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 773 aa  226  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 773 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 802 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 762 aa  224  3e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 666 aa  224  6e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 817 aa  223  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 741 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 761 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 732 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 769 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 713 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1722  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 767 aa  220  8.999999999999998e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 761 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3466  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 718 aa  217  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.88 
 
 		 739 aa  217  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 753 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0880  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 680 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 783 aa  212  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 712 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1807  putative siderophore receptor protein  28.77 
 
 		 691 aa  210  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 713 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 790 aa  206  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 712 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.22 
 
 		 759 aa  206  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2093  yersiniabactin/pesticin receptor FyuA  28.89 
 
 		 673 aa  205  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 774 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 784 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 757 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 783 aa  204  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 786 aa  203  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 780 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 703 aa  203  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 808 aa  203  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 790 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 748 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.99 
 
 		 755 aa  201  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 790 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 800 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 800 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 763 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 728 aa  200  7.999999999999999e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 792 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 741 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 736 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1436  TonB-dependent siderophore receptor  28.86 
 
 		 669 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 778 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 755 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 790 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3046  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 722 aa  197  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.770987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.03 
 
 		 755 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 838 aa  196  1e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 777 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 776 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 794 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 732 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 797 aa  194  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 730 aa  194  6e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 755 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 778 aa  193  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 803 aa  193  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 771 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.98 
 
 		 776 aa  193  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.32 
 
 		 751 aa  192  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 717 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>