More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3538 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  98.71 
 
 		 773 aa  1481    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  94.57 
 
 		 773 aa  1468    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 771 aa  1572    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  40.77 
 
 		 747 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 794 aa  465  1e-129  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 763 aa  325  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 755 aa  272  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  30.46 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 775 aa  271  2.9999999999999997e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 761 aa  267  7e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 728 aa  264  6e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 757 aa  261  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 722 aa  260  8e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 731 aa  258  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 758 aa  255  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 		 704 aa  254  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 783 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 790 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 732 aa  251  3e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 771 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 743 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 737 aa  248  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 756 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.66 
 
 		 739 aa  248  4e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 746 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 750 aa  245  1.9999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 776 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 758 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 758 aa  244  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 761 aa  243  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 743 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02728  TonB-dependent outer membrane receptor  29.69 
 
 		 738 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 761 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 764 aa  238  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 792 aa  237  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 736 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 725 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 779 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 741 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 720 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  31.68 
 
 		 742 aa  234  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.92 
 
 		 715 aa  233  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1059  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 777 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000502668  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 730 aa  233  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  29.29 
 
 		 762 aa  233  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 710 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1977  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 769 aa  230  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 774 aa  229  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 759 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.86 
 
 		 759 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 729 aa  227  6e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 803 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 726 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 775 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 790 aa  225  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 743 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.89 
 
 		 766 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 784 aa  224  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 748 aa  223  8e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 730 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 763 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 808 aa  221  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.79 
 
 		 728 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 758 aa  220  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 754 aa  218  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 782 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 780 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 758 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 726 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 749 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 780 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 779 aa  217  5e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 790 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 764 aa  216  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 723 aa  215  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 758 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 		 730 aa  214  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 804 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 734 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 733 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 745 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 796 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 726 aa  207  7e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 778 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 695 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  29.54 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.48 
 
 		 755 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 803 aa  204  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 778 aa  203  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.3 
 
 		 759 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 777 aa  202  3e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 713 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 822 aa  201  3.9999999999999996e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 744 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 730 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 873 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>