More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1664 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  78.48 
 
 
783 aa  1220    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  100 
 
 
797 aa  1627    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  44.27 
 
 
797 aa  581  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 
798 aa  484  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  34.54 
 
 
741 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  33.25 
 
 
755 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 
761 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2919  TonB-dependent receptor  32.72 
 
 
763 aa  336  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.239028  normal  0.201579 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 
757 aa  324  4e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 
838 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  29.01 
 
 
783 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
780 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
763 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.35 
 
 
739 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
769 aa  230  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 
749 aa  224  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 
864 aa  222  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
741 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
710 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 
761 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 
775 aa  218  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
777 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 
778 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 
790 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
778 aa  214  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 
803 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  28.57 
 
 
790 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 
771 aa  209  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.49 
 
 
695 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
790 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.4 
 
 
903 aa  207  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 
732 aa  207  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 
767 aa  206  1e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 
736 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 
720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
729 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
730 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 
771 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 
780 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 
730 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 
919 aa  198  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 
769 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
747 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 
724 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 
759 aa  196  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
733 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
825 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 
732 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 
737 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.56 
 
 
786 aa  194  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 
835 aa  194  5e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 
751 aa  194  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
896 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 
822 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 
761 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 
734 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
860 aa  191  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 
726 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 
784 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  26.52 
 
 
797 aa  190  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 
766 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 
786 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
755 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  27.89 
 
 
754 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
764 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
785 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
779 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 
762 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 
779 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
824 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 
808 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 
862 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 
880 aa  184  7e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 
758 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 
713 aa  183  9.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 
765 aa  183  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 
743 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 
759 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
779 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  26.18 
 
 
715 aa  181  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 
773 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
764 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5129  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 
771 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 
814 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 
788 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 
784 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
730 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 
756 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
725 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
817 aa  177  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 
776 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
758 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 
937 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.33 
 
 
775 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 
722 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
800 aa  174  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 
800 aa  174  5e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 
743 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  26 
 
 
738 aa  174  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>