More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2368 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 712 aa  1441    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 763 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 771 aa  288  2.9999999999999996e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  31.82 
 
 		 753 aa  278  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 802 aa  272  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  30.06 
 
 		 784 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  31.09 
 
 		 822 aa  252  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 747 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 752 aa  246  8e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 757 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 762 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 786 aa  239  1e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  27.65 
 
 		 889 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 795 aa  237  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  29.08 
 
 		 785 aa  236  9e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 734 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 795 aa  234  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 856 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  30.82 
 
 		 695 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 713 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 709 aa  220  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 777 aa  218  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 780 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 791 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 781 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.46 
 
 		 715 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 777 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 742 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 780 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  29.78 
 
 		 700 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 766 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 702 aa  207  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  28.15 
 
 		 795 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 724 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 808 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 710 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 806 aa  193  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 792 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 808 aa  191  5e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 730 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4253  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 713 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.90601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 747 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 726 aa  184  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 731 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 798 aa  184  6e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 720 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 802 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  28.64 
 
 		 804 aa  182  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 722 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 794 aa  179  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 753 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 797 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 763 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 704 aa  174  5e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.35 
 
 		 759 aa  174  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 771 aa  173  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 851 aa  173  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 853 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 784 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 788 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 774 aa  171  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 761 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  25.52 
 
 		 748 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 847 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 769 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 817 aa  167  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 730 aa  166  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4114  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 703 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1533  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 720 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.63878  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 733 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  35.59 
 
 		 365 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.89 
 
 		 755 aa  162  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  26.51 
 
 		 830 aa  161  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 809 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 732 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  28.09 
 
 		 801 aa  160  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 720 aa  160  7e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 755 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 728 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 735 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 734 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 687 aa  157  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  25.76 
 
 		 829 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 761 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 710 aa  156  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 737 aa  156  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 763 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 726 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 743 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 758 aa  155  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 770 aa  155  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 		 731 aa  154  5.9999999999999996e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 790 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 732 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 757 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>