More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2426 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 804 aa  1600    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  41.13 
 
 		 829 aa  500  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  35.73 
 
 		 756 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  34.13 
 
 		 770 aa  353  8e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  30.45 
 
 		 801 aa  301  4e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  30.32 
 
 		 829 aa  292  2e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 753 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  28.66 
 
 		 771 aa  218  2.9999999999999998e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 802 aa  214  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.64 
 
 		 847 aa  213  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 763 aa  210  8e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 747 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 795 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 757 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  26.63 
 
 		 856 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 795 aa  185  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 712 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 806 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.56 
 
 		 784 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 786 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  24.3 
 
 		 846 aa  175  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 777 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 822 aa  172  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 795 aa  171  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  27.75 
 
 		 802 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 752 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 792 aa  161  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  26 
 
 		 785 aa  161  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 797 aa  161  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 791 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 734 aa  156  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  23.73 
 
 		 889 aa  154  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 808 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 753 aa  151  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 742 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 780 aa  146  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 766 aa  144  5e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 780 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  23.13 
 
 		 808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 781 aa  133  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  21.13 
 
 		 883 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 763 aa  130  8.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 779 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 763 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 		 725 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 777 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.12 
 
 		 695 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4145  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 737 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072691  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 794 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  24.9 
 
 		 761 aa  122  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  25.04 
 
 		 730 aa  121  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 875 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 751 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.27 
 
 		 724 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 747 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 687 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.36 
 
 		 731 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 807 aa  115  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 755 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0190  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 710 aa  114  5e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 786 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 710 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1050  TonB-dependent receptor, plug  24.56 
 
 		 830 aa  114  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.908027 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 713 aa  114  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 		 731 aa  114  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 690 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 851 aa  113  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 704 aa  113  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 853 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 761 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 904 aa  111  5e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1574  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 695 aa  111  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000898905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 780 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 764 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 690 aa  110  9.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.64 
 
 		 755 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 788 aa  109  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 684 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 775 aa  108  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 732 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 803 aa  107  9e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.45 
 
 		 726 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 732 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 729 aa  106  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 736 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  23.77 
 
 		 798 aa  105  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 767 aa  105  5e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 720 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 775 aa  104  8e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  35.58 
 
 		 762 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 741 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 793 aa  103  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 730 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  23.05 
 
 		 776 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 778 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 702 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 720 aa  102  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 778 aa  102  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0657  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 666 aa  101  5e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>