More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1502 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  51.31 
 
 		 829 aa  735    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 801 aa  1570    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  46.42 
 
 		 770 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  33.95 
 
 		 829 aa  320  6e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 804 aa  313  5.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  34.07 
 
 		 756 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 847 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  29.15 
 
 		 856 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 792 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 734 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 753 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 795 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 763 aa  167  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 712 aa  160  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.84 
 
 		 822 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.34 
 
 		 784 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 802 aa  153  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 766 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 795 aa  146  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 757 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  31.93 
 
 		 771 aa  144  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 777 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 795 aa  137  9e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 786 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  25.61 
 
 		 785 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 802 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  33.98 
 
 		 797 aa  129  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 747 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 769 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 875 aa  124  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 780 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  34.43 
 
 		 742 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 806 aa  122  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 365 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  28.41 
 
 		 889 aa  118  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 780 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 704 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1672  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 853 aa  114  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0105669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0185  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 851 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 732 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 904 aa  114  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 762 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.14 
 
 		 715 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.18 
 
 		 776 aa  110  8.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  23.75 
 
 		 791 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 751 aa  107  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 798 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 781 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 808 aa  104  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 713 aa  103  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 796 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  22.85 
 
 		 753 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.96 
 
 		 737 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 729 aa  100  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 780 aa  99.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0787  TonB-dependent receptor  23.44 
 
 		 788 aa  99.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.114604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 886 aa  99.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 722 aa  99  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 720 aa  98.2  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 763 aa  98.2  6e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 883 aa  97.8  8e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 720 aa  96.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  31.06 
 
 		 777 aa  96.3  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  29.61 
 
 		 846 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3471  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 788 aa  95.5  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.104245  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 743 aa  95.1  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 687 aa  94.7  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  22.71 
 
 		 783 aa  94.4  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  23.29 
 
 		 809 aa  94  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 735 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 730 aa  93.2  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 726 aa  92.4  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  23.42 
 
 		 774 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  27.39 
 
 		 926 aa  91.3  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 690 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 747 aa  91.3  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55050  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 684 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501937  unclonable  1.04288e-20 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  21.96 
 
 		 690 aa  90.1  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 743 aa  90.1  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2064  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 697 aa  89  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.969634  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 757 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  28.95 
 
 		 729 aa  88.2  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 775 aa  88.6  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  23.79 
 
 		 739 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1735  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 713 aa  87.8  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00374581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 730 aa  87.8  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 766 aa  87.8  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2310  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 732 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0299343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1841  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 743 aa  87.8  8e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000217461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 757 aa  87.4  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 		 722 aa  86.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 725 aa  87  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2380  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 748 aa  87  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.357323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  23.94 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 746 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  23.79 
 
 		 700 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>