More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1106 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1502  TonB-dependent receptor, plug  50.6 
 
 		 801 aa  711    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1106  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 829 aa  1658    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1810  TonB-dependent receptor  41.48 
 
 		 770 aa  533  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4738  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 756 aa  301  3e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2426  TonB-dependent receptor plug  30.32 
 
 		 804 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812429  normal  0.91606 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2726  TonB-dependent receptor plug  31.06 
 
 		 829 aa  266  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.298925 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1077  TonB-dependent receptor, plug  28.4 
 
 		 856 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 795 aa  156  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 		 752 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0686  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 777 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 753 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 734 aa  134  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.1 
 
 		 822 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2646  TonB-dependent receptor plug  26.77 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.994259 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 766 aa  128  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 808 aa  120  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0939  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.549215  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 792 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  24.29 
 
 		 784 aa  119  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2226  TonB-dependent receptor, plug  25.9 
 
 		 785 aa  117  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0931  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 747 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.171223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1673  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 757 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3168  TonB-dependent receptor  23.69 
 
 		 795 aa  114  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.43685  normal  0.501895 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 712 aa  114  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2328  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 786 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 802 aa  108  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 753 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2420  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 777 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.180435  normal  0.160196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4751  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 795 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0405819 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1676  TonB-dependent receptor  22.76 
 
 		 875 aa  102  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233734  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4008  TonB-dependent receptor plug  30.31 
 
 		 365 aa  99.8  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.139697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2647  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 847 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.492144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1053  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 		 791 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3036  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 904 aa  96.3  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.637497  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5246  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 762 aa  95.1  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.751713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  24.15 
 
 		 704 aa  92.8  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0613  TonB-dependent receptor  23.15 
 
 		 808 aa  92.4  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0149  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 802 aa  92.8  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0289902  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 720 aa  92  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0921  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 889 aa  92  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2580  TonB-dependent receptor  31.47 
 
 		 806 aa  91.3  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.531005  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03169  TonB-dependent receptor  31.91 
 
 		 797 aa  90.9  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0023848  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 777 aa  89.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  21.94 
 
 		 776 aa  89.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0767  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 883 aa  89.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000108797  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0714  TonB-dependent receptor  22.04 
 
 		 780 aa  88.6  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.116243  decreased coverage  0.000166351 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3241  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 780 aa  88.2  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.188368  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4302  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 742 aa  87.4  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 741 aa  85.9  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  23.35 
 
 		 710 aa  85.5  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 780 aa  83.2  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 687 aa  82  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2612  TonB-dependent receptor  32.74 
 
 		 807 aa  81.6  0.00000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 780 aa  81.6  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2650  TonB-dependent receptor, plug  32.47 
 
 		 846 aa  81.3  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 763 aa  80.9  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0968  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 709 aa  80.9  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  26.12 
 
 		 833 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  22.27 
 
 		 690 aa  79.7  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02386  TonB-dependent receptor  32.84 
 
 		 886 aa  80.1  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4197  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000540128  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  28.23 
 
 		 737 aa  78.2  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 		 690 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  22.64 
 
 		 764 aa  76.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  22.84 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 779 aa  75.5  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2060  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 781 aa  74.7  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 755 aa  74.3  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4276  TonB-dependent receptor  37.69 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 926 aa  74.3  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 776 aa  74.3  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  23.21 
 
 		 743 aa  73.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4085  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 685 aa  74.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.141893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  23.33 
 
 		 759 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 779 aa  73.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  27.04 
 
 		 812 aa  73.2  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2752  TonB-dependent receptor  29.74 
 
 		 736 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000933457  normal  0.355865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  21.59 
 
 		 775 aa  72.8  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 720 aa  72.4  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  22.19 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1451  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 730 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.322984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  30.38 
 
 		 786 aa  71.2  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1526  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 733 aa  71.2  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.208571  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  23 
 
 		 790 aa  71.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2321  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 744 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.130994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 769 aa  70.5  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2500  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 757 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0249349  hitchhiker  0.00279942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 767 aa  69.7  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  21.77 
 
 		 761 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4696  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 763 aa  70.1  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.383832  normal  0.747647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.92 
 
 		 806 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1828  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 712 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000226653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 743 aa  69.3  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  30.07 
 
 		 831 aa  68.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.94 
 
 		 755 aa  68.9  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  23.65 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1886  TonB-dependent receptor plug  29.55 
 
 		 729 aa  68.6  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.270024  normal  0.821548 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  23.14 
 
 		 741 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 725 aa  68.2  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>