More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2383 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  50.06 
 
 		 836 aa  750    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 926 aa  1875    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1967  TonB-dependent receptor plug  37.96 
 
 		 929 aa  516  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.559589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  38.21 
 
 		 786 aa  462  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4852  TonB-dependent receptor  34.69 
 
 		 772 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 783 aa  344  4e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 771 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03469  Outer membrane protein  25.15 
 
 		 760 aa  209  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 906 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 723 aa  205  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 		 758 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 744 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 783 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 728 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 777 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 764 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 864 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 773 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 862 aa  172  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 773 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 761 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 785 aa  171  8e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  24.19 
 
 		 737 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 773 aa  168  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 771 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 763 aa  167  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 810 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1463  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 822 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 903 aa  165  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 743 aa  165  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 777 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 		 809 aa  164  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 726 aa  164  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 784 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 767 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 919 aa  161  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 775 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 797 aa  157  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 838 aa  157  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 794 aa  156  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 804 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 896 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 862 aa  151  4e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  24.01 
 
 		 780 aa  151  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4206  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 752 aa  151  6e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.315685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 725 aa  150  9e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 786 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 751 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.09 
 
 		 783 aa  148  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 880 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2711  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 766 aa  147  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.918859  normal  0.60729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2368  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 712 aa  147  9e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.59256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 767 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  24.62 
 
 		 776 aa  145  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 860 aa  145  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4347  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 795 aa  144  9e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.71 
 
 		 789 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  24.44 
 
 		 763 aa  144  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 778 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 780 aa  141  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 797 aa  141  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  32.17 
 
 		 769 aa  140  7.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1081  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 734 aa  140  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 803 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.13 
 
 		 767 aa  140  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 736 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 713 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1679  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 742 aa  137  8e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0383405 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  24.6 
 
 		 835 aa  135  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 774 aa  135  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.17 
 
 		 739 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 787 aa  135  5e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.72 
 
 		 776 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 854 aa  134  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 778 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0535  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  24.52 
 
 		 862 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  38.5 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 822 aa  132  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 731 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 720 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 808 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  24.14 
 
 		 839 aa  128  6e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 815 aa  127  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 794 aa  126  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 743 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 780 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 809 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 748 aa  125  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 738 aa  125  4e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 785 aa  125  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  23.23 
 
 		 848 aa  124  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 790 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 766 aa  124  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  29.97 
 
 		 755 aa  124  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 704 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 809 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.3 
 
 		 710 aa  123  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.77 
 
 		 784 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>