More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1360 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  60.52 
 
 		 822 aa  986    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 810 aa  1652    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  32.63 
 
 		 767 aa  403  1e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  33.25 
 
 		 790 aa  386  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  33.75 
 
 		 764 aa  385  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  33.17 
 
 		 785 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  32.69 
 
 		 773 aa  363  6e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 809 aa  359  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 779 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 784 aa  347  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 777 aa  341  4e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 795 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 771 aa  301  5e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 857 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 763 aa  241  4e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 		 758 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 		 755 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 756 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 730 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 864 aa  218  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 730 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 782 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 838 aa  213  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3344  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 791 aa  211  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 722 aa  210  7e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 723 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 777 aa  207  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 747 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 728 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.82 
 
 		 797 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.95 
 
 		 739 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 743 aa  201  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 729 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  26.82 
 
 		 759 aa  200  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 726 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 761 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 767 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 704 aa  196  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.16 
 
 		 839 aa  196  1e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 751 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 732 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.24 
 
 		 783 aa  193  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 		 769 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.12 
 
 		 765 aa  188  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 737 aa  187  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.53 
 
 		 780 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 794 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 758 aa  184  5.0000000000000004e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 728 aa  184  6e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 792 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 773 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 797 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 780 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 778 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 789 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 746 aa  177  7e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 730 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 863 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 817 aa  175  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  24.97 
 
 		 755 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 783 aa  175  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 764 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 803 aa  174  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 743 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 722 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 758 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 767 aa  171  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.68 
 
 		 774 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 809 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 735 aa  170  8e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 774 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 741 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 796 aa  169  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  23.18 
 
 		 764 aa  167  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  25.37 
 
 		 790 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 926 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 803 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 779 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.06 
 
 		 755 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.73 
 
 		 856 aa  166  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.88 
 
 		 809 aa  165  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 720 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 829 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  24.35 
 
 		 812 aa  164  5.0000000000000005e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 749 aa  164  9e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  25.63 
 
 		 763 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 784 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 757 aa  162  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 730 aa  162  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  24.88 
 
 		 803 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 919 aa  160  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 764 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  25.32 
 
 		 726 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 725 aa  158  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>