More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1982 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 
809 aa  1646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1110  Outer membrane receptor protein mostly Fe transport-like protein  28.11 
 
 
862 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 
783 aa  242  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
780 aa  237  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
704 aa  236  1.0000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.55 
 
 
776 aa  228  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.46 
 
 
777 aa  226  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
741 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
822 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 
730 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 
766 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 
860 aa  217  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 
761 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 
764 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.59 
 
 
751 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 
729 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 
780 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 
755 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 
764 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 
783 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 
763 aa  211  3e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 
723 aa  210  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
747 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 
773 aa  208  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.22 
 
 
758 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.5 
 
 
739 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 
765 aa  206  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
803 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
730 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 
832 aa  205  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 
710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.06 
 
 
839 aa  202  1.9999999999999998e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 
726 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.92 
 
 
792 aa  200  9e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 
774 aa  200  9e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 
730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 
862 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 
774 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 
764 aa  197  8.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
728 aa  197  9e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1913  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 
862 aa  194  5e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 
734 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 
743 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 
903 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 
744 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 
783 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 
779 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
790 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.45 
 
 
785 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 
743 aa  190  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 
919 aa  190  1e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 
738 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 
864 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 
749 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 
737 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  24.4 
 
 
762 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 
751 aa  188  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  26.1 
 
 
765 aa  188  4e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 
807 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 
767 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 
775 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  23.76 
 
 
763 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  26.58 
 
 
880 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  25.76 
 
 
733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  24.54 
 
 
785 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 
806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 
743 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 
808 aa  185  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 
753 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 
776 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  26.19 
 
 
767 aa  184  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 
758 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 
896 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 
771 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  23.91 
 
 
758 aa  182  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 
767 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 
780 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 
726 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25.3 
 
 
759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  23.16 
 
 
761 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 
838 aa  181  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 
758 aa  181  7e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 
713 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 
758 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 
779 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.37 
 
 
784 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 
795 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 
758 aa  179  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
794 aa  178  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 
773 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 
784 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 
782 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 
777 aa  177  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 
775 aa  177  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 
750 aa  177  9.999999999999999e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 
730 aa  176  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  23.7 
 
 
728 aa  177  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 
790 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 
809 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.59 
 
 
759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>