More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1859 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 776 aa  1582    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  34.3 
 
 		 780 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 776 aa  398  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  35.27 
 
 		 779 aa  389  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  33.2 
 
 		 775 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  31.29 
 
 		 769 aa  342  1e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 783 aa  295  3e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 793 aa  286  9e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 803 aa  270  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 720 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 843 aa  233  1e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 775 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.97 
 
 		 739 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 755 aa  217  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 761 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 741 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.7 
 
 		 792 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 743 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 726 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 780 aa  212  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 749 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 713 aa  210  8e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 763 aa  210  9e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 747 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 730 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 790 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.41 
 
 		 755 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.34 
 
 		 756 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 780 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 735 aa  204  4e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 732 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 777 aa  203  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 741 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 755 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 838 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 780 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 733 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 766 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.75 
 
 		 764 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 723 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.56 
 
 		 903 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 783 aa  192  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 753 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 808 aa  191  4e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 745 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 790 aa  190  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 817 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 704 aa  189  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 864 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 734 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  28.55 
 
 		 759 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 757 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 794 aa  187  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 730 aa  187  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 808 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  25.73 
 
 		 695 aa  184  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0914  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 802 aa  184  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 730 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  25.85 
 
 		 736 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 765 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 803 aa  181  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 758 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 761 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 803 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 730 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 789 aa  180  8e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.94 
 
 		 839 aa  180  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  28.2 
 
 		 755 aa  180  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1343  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 755 aa  179  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 767 aa  178  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.62 
 
 		 715 aa  178  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 796 aa  178  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 764 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 744 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.17 
 
 		 786 aa  177  7e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 880 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 728 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 731 aa  176  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 751 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 717 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 812 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 807 aa  175  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 710 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 722 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 784 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 773 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 733 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.03 
 
 		 746 aa  173  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.64 
 
 		 784 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 771 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 765 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 797 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 764 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 767 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 773 aa  171  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 713 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 774 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 797 aa  169  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>