More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4555 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 803 aa  1640    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  32.88 
 
 		 769 aa  388  1e-106  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  32.98 
 
 		 783 aa  382  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  30 
 
 		 793 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  28.04 
 
 		 776 aa  277  7e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  29.96 
 
 		 779 aa  270  5.9999999999999995e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  30.18 
 
 		 775 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  29.47 
 
 		 764 aa  249  2e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  26.76 
 
 		 765 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 780 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 840 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  35.05 
 
 		 776 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 862 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 758 aa  201  3e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 824 aa  200  7e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  30.84 
 
 		 713 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  26.8 
 
 		 776 aa  196  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  25.68 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 761 aa  191  5e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 843 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 773 aa  188  4e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 808 aa  187  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 762 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 783 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 838 aa  186  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 743 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 896 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.01 
 
 		 864 aa  184  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 773 aa  184  7e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 786 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  25.88 
 
 		 774 aa  183  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 903 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 815 aa  181  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 803 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  26.53 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 790 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 792 aa  179  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 778 aa  178  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  29.93 
 
 		 729 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 751 aa  178  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 761 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 860 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 796 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  25.28 
 
 		 789 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 722 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  24.91 
 
 		 748 aa  174  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 784 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 810 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 735 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 829 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  24.69 
 
 		 857 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 775 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 710 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 778 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 809 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 734 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 808 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 726 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 763 aa  167  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 880 aa  167  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  25.44 
 
 		 777 aa  167  9e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 		 765 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 732 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 747 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 759 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 832 aa  164  4.0000000000000004e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4088  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 814 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0165324  normal  0.80601 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 796 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  24.75 
 
 		 780 aa  164  6e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 792 aa  164  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 873 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3088  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 835 aa  163  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.285455  normal  0.0146204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 758 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  24.2 
 
 		 755 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 794 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 803 aa  161  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 785 aa  161  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 741 aa  160  6e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 730 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2865  TonB-dependent receptor  25.46 
 
 		 798 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000308376  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 761 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 855 aa  160  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 822 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  25.16 
 
 		 794 aa  158  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.83 
 
 		 755 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 737 aa  157  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  28.16 
 
 		 758 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 774 aa  157  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 777 aa  157  8e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 807 aa  156  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 757 aa  156  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1887  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 848 aa  155  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>