More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4330 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1581    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  52.41 
 
 		 776 aa  770    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  33.97 
 
 		 776 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 775 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 779 aa  360  4e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  32.29 
 
 		 769 aa  331  3e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 840 aa  289  1e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 783 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 843 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.13 
 
 		 739 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.82 
 
 		 720 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 824 aa  238  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.06 
 
 		 765 aa  237  8e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 787 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 730 aa  234  5e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 732 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 803 aa  231  5e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  30.22 
 
 		 753 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 734 aa  226  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 777 aa  225  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 785 aa  224  4.9999999999999996e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 726 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 784 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 741 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 749 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 747 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  28.71 
 
 		 754 aa  221  6e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 704 aa  220  7e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 793 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 769 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 838 aa  220  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 743 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 745 aa  219  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 896 aa  218  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 710 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29 
 
 		 736 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.77 
 
 		 722 aa  216  9.999999999999999e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 864 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 763 aa  215  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 756 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 722 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 723 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 771 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 786 aa  212  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 780 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  28.14 
 
 		 785 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 764 aa  208  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 730 aa  207  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 780 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.38 
 
 		 730 aa  206  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.91 
 
 		 755 aa  205  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  25.82 
 
 		 755 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 919 aa  204  4e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  29.5 
 
 		 726 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 751 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  28.67 
 
 		 796 aa  204  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 761 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 741 aa  201  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.43 
 
 		 775 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 780 aa  200  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 771 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 767 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.51 
 
 		 759 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 758 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.02 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 725 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3981  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 773 aa  195  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.139446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 758 aa  195  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 728 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 761 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 782 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.73 
 
 		 767 aa  193  9e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 809 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 794 aa  190  7e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 783 aa  191  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 794 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 729 aa  189  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 766 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 690 aa  189  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 737 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 690 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 790 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  25.92 
 
 		 743 aa  188  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 790 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 733 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 755 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 733 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  25.29 
 
 		 765 aa  187  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 717 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.45 
 
 		 809 aa  187  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  24.65 
 
 		 839 aa  187  9e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 790 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 797 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>