More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0516 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 773 aa  1586    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  42.09 
 
 		 785 aa  565  1.0000000000000001e-159  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 767 aa  542  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  40.15 
 
 		 764 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  39.05 
 
 		 795 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  39.39 
 
 		 790 aa  513  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  39.12 
 
 		 779 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  37.58 
 
 		 809 aa  496  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 784 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 822 aa  419  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1443  TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 863 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 810 aa  360  5e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 777 aa  352  1e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 771 aa  310  6.999999999999999e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.23 
 
 		 755 aa  258  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 763 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 857 aa  251  3e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 758 aa  248  2e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 720 aa  244  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  29.92 
 
 		 732 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 756 aa  238  3e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 734 aa  235  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 779 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 730 aa  227  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 769 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 751 aa  224  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 737 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 743 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 761 aa  218  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 725 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 803 aa  214  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  27.16 
 
 		 782 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 747 aa  212  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 739 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4173  TonB-dependent receptor  28.8 
 
 		 763 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.000000000121747  normal  0.086797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.85 
 
 		 759 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 723 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 746 aa  208  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.08 
 
 		 777 aa  208  4e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 722 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 785 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 735 aa  207  9e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 743 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  28.27 
 
 		 809 aa  206  1e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 790 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.38 
 
 		 730 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 780 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 726 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 761 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 704 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 765 aa  198  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 710 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 700 aa  196  9e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4611  TonB-dependent receptor, plug  27.99 
 
 		 784 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 743 aa  196  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3941  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 792 aa  195  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.78272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 792 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 771 aa  194  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.74 
 
 		 773 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 838 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 726 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 744 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 730 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 856 aa  192  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 797 aa  190  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 780 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 786 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 766 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 736 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 783 aa  188  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 773 aa  188  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 790 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.81 
 
 		 808 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 784 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 753 aa  187  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 790 aa  187  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 767 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 767 aa  186  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.41 
 
 		 757 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 749 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 812 aa  184  5.0000000000000004e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 803 aa  184  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 778 aa  184  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 789 aa  183  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 728 aa  184  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.48 
 
 		 733 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 755 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 794 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 764 aa  179  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 717 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 728 aa  180  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 771 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 903 aa  179  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>