More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3437 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 812 aa  1654    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 829 aa  543  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  37.45 
 
 		 796 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  37.79 
 
 		 789 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  34.15 
 
 		 794 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 808 aa  376  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 735 aa  333  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 766 aa  269  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 730 aa  239  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 722 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 738 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 807 aa  226  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.81 
 
 		 739 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 775 aa  217  8e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 822 aa  213  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 734 aa  211  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 783 aa  210  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 785 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 765 aa  203  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 726 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 757 aa  203  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 741 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 756 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 784 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 779 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 780 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 763 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 790 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 749 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 784 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 771 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 731 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 723 aa  184  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 773 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 896 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 755 aa  184  8.000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 755 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  26.85 
 
 		 856 aa  181  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.91 
 
 		 780 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 761 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 790 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 758 aa  177  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 746 aa  176  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  25.15 
 
 		 776 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 773 aa  174  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  31.75 
 
 		 744 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  26.06 
 
 		 783 aa  172  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 796 aa  172  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 767 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 864 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 725 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 817 aa  171  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  31.31 
 
 		 704 aa  171  6e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 832 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 767 aa  171  7e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.28 
 
 		 903 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 771 aa  170  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 775 aa  169  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 761 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 737 aa  168  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.47 
 
 		 776 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 730 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 758 aa  167  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  34.14 
 
 		 747 aa  167  9e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 854 aa  166  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.67 
 
 		 857 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.49 
 
 		 838 aa  166  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 730 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.21 
 
 		 859 aa  164  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  26.18 
 
 		 785 aa  163  1e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 803 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.03 
 
 		 809 aa  162  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  25.58 
 
 		 743 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  30.04 
 
 		 759 aa  160  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 730 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  24.48 
 
 		 764 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 919 aa  159  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 779 aa  158  4e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  26.63 
 
 		 795 aa  158  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 728 aa  158  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 710 aa  157  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  26.64 
 
 		 797 aa  157  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 769 aa  155  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 795 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 761 aa  156  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 810 aa  154  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 860 aa  153  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 862 aa  153  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 790 aa  153  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  25.03 
 
 		 759 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 758 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 722 aa  150  7e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  24.77 
 
 		 808 aa  150  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 860 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  24.65 
 
 		 803 aa  149  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 790 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0246  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 948 aa  149  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000304419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2950  TonB-dependent receptor, plug  26.41 
 
 		 850 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101832  normal  0.0641531 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 809 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>