More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0865 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 829 aa  1683    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 812 aa  543  1e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  34.47 
 
 		 796 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  33.46 
 
 		 789 aa  378  1e-103  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  31.74 
 
 		 794 aa  352  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  32.94 
 
 		 808 aa  348  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 780 aa  215  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 735 aa  204  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 822 aa  202  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.64 
 
 		 776 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 764 aa  196  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3901  TonB-dependent receptor, plug  24.94 
 
 		 797 aa  187  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  24.43 
 
 		 838 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 730 aa  184  7e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  24.8 
 
 		 783 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2870  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 857 aa  181  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 757 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 864 aa  178  4e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.89 
 
 		 766 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  24.86 
 
 		 809 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0246  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 948 aa  171  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000304419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 803 aa  170  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 783 aa  170  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  24 
 
 		 839 aa  168  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 729 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3795  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 880 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.59 
 
 		 771 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  25.12 
 
 		 774 aa  164  6e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 746 aa  164  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  24.52 
 
 		 810 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 744 aa  161  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 755 aa  161  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01058  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 860 aa  160  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.84 
 
 		 747 aa  160  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  31.66 
 
 		 741 aa  160  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 775 aa  159  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  23.86 
 
 		 796 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 896 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 762 aa  156  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  24.32 
 
 		 777 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 779 aa  153  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  29.8 
 
 		 733 aa  153  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 784 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 903 aa  151  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  28.29 
 
 		 767 aa  150  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 741 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.46 
 
 		 737 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  23.05 
 
 		 792 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 749 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  28.72 
 
 		 778 aa  148  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  23.25 
 
 		 792 aa  147  8.000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 770 aa  147  8.000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 784 aa  147  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 778 aa  147  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 769 aa  146  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  38.26 
 
 		 759 aa  147  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 815 aa  147  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  36.36 
 
 		 807 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 785 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 720 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  24.91 
 
 		 758 aa  145  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 803 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 710 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 761 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 750 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.75 
 
 		 731 aa  143  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 794 aa  143  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  31.13 
 
 		 817 aa  142  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  23.3 
 
 		 780 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.98 
 
 		 803 aa  140  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 747 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  29.57 
 
 		 763 aa  139  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 723 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 728 aa  139  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  23.84 
 
 		 832 aa  138  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 765 aa  138  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  27.52 
 
 		 758 aa  138  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.61 
 
 		 704 aa  138  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 730 aa  137  8e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  24.36 
 
 		 743 aa  137  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0037  TonB-dependent receptor  29.25 
 
 		 757 aa  137  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.22969  hitchhiker  0.0000467623 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 782 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  24.84 
 
 		 755 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0785  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 829 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.324932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  24.05 
 
 		 809 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  29.44 
 
 		 739 aa  135  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 855 aa  135  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 734 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 732 aa  134  6.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 772 aa  133  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 786 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 738 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3635  TonB-dependent receptor, plug  28.34 
 
 		 751 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000221173  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.51 
 
 		 725 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.83 
 
 		 777 aa  132  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  36.04 
 
 		 971 aa  131  5.0000000000000004e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 786 aa  131  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1080  TonB-dependent receptor  37.39 
 
 		 937 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72185  normal  0.584922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>