More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0246 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0246  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 948 aa  1921    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0000304419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0865  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 		 829 aa  171  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0714067  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 766 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 808 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 789 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 807 aa  151  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 723 aa  150  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3437  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 812 aa  149  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.81 
 
 		 744 aa  149  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 738 aa  148  4.0000000000000006e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.86 
 
 		 739 aa  148  5e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  27.94 
 
 		 733 aa  145  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 794 aa  143  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 730 aa  142  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.84 
 
 		 747 aa  142  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  26.83 
 
 		 797 aa  141  7e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.51 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 759 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 735 aa  134  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 796 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.08 
 
 		 787 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 		 783 aa  129  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 704 aa  128  6e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 741 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 758 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 780 aa  126  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  28.82 
 
 		 717 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 792 aa  124  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 777 aa  122  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1633  TonB-dependent receptor, plug  34.12 
 
 		 906 aa  121  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257863  normal  0.346647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  25.56 
 
 		 776 aa  119  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  38.64 
 
 		 731 aa  119  3.9999999999999997e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  32.6 
 
 		 730 aa  118  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 755 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 734 aa  116  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 722 aa  115  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  37.5 
 
 		 795 aa  115  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 771 aa  114  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  32.71 
 
 		 737 aa  112  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 796 aa  112  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 761 aa  112  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  27.69 
 
 		 730 aa  111  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  25.05 
 
 		 792 aa  111  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  25.1 
 
 		 806 aa  111  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  32.68 
 
 		 757 aa  110  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2215  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 971 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.169336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  26.18 
 
 		 755 aa  109  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3422  TonB-dependent receptor, plug  32.41 
 
 		 345 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209041  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 728 aa  108  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 825 aa  109  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 779 aa  109  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2383  TonB-dependent receptor  31.7 
 
 		 926 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 729 aa  108  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.96 
 
 		 765 aa  108  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  24.92 
 
 		 764 aa  108  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 794 aa  108  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 775 aa  107  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3629  TonB-dependent receptor, plug  33.97 
 
 		 807 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.824698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 896 aa  107  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  30.91 
 
 		 720 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 743 aa  107  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 789 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  26.86 
 
 		 759 aa  106  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0572  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 758 aa  106  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 725 aa  106  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 749 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  24.95 
 
 		 733 aa  105  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 770 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2405  TonB-dependent receptor, plug  31.97 
 
 		 786 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0816065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1912  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 969 aa  105  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  32.7 
 
 		 731 aa  104  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1810  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 862 aa  104  9e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397284  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0414  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 783 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 730 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  25.54 
 
 		 832 aa  103  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 728 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0346  TonB-dependent receptor  37.36 
 
 		 836 aa  103  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  29.58 
 
 		 763 aa  103  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.7 
 
 		 780 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 764 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  25.06 
 
 		 761 aa  103  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  22.74 
 
 		 761 aa  103  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 758 aa  103  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 743 aa  102  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 774 aa  102  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 700 aa  102  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 864 aa  102  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 795 aa  102  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  24.64 
 
 		 860 aa  102  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 769 aa  101  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3281  TonB-dependent receptor, plug  38.2 
 
 		 797 aa  101  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.475296 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0450  TonB-dependent receptor, plug  32.78 
 
 		 487 aa  100  9e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144048  normal  0.622728 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  28.81 
 
 		 789 aa  100  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  33.49 
 
 		 817 aa  100  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  25.94 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 732 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2033  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 818 aa  100  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.795127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03368  putative TonB-dependent receptor  25.4 
 
 		 754 aa  100  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 784 aa  100  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  30.62 
 
 		 774 aa  99.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>