More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0808 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0808  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 733 aa  1497    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 744 aa  304  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  31.71 
 
 		 766 aa  283  6.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  30.92 
 
 		 747 aa  273  1e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 738 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  28.46 
 
 		 735 aa  241  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  27.36 
 
 		 704 aa  236  8e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 747 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  28.35 
 
 		 710 aa  230  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 759 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 789 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  27.79 
 
 		 733 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5026  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.95 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 722 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 758 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 723 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.05 
 
 		 730 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 758 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 790 aa  203  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 794 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 761 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 743 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 759 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 746 aa  198  3e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 792 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  26.8 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  27.01 
 
 		 739 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  27.62 
 
 		 777 aa  193  9e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  26.79 
 
 		 737 aa  192  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 796 aa  190  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 741 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  26.4 
 
 		 743 aa  187  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  25.17 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  24.44 
 
 		 729 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 784 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  25.49 
 
 		 789 aa  184  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  24.23 
 
 		 750 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 779 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 765 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 780 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  27.11 
 
 		 773 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1688  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 774 aa  180  7e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  25.37 
 
 		 809 aa  179  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 743 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  26.56 
 
 		 756 aa  178  4e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0865  TonB-dependent receptor  26.94 
 
 		 720 aa  178  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0447976  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 761 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 722 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.31 
 
 		 764 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  25.59 
 
 		 807 aa  175  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  25.39 
 
 		 772 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  27.81 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 726 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 764 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  24.33 
 
 		 789 aa  174  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 767 aa  174  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 725 aa  174  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 771 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  25.3 
 
 		 755 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2040  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 		 815 aa  172  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.862919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2998  helix-turn-helix, AraC type  27.35 
 
 		 797 aa  172  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.167643  hitchhiker  0.0000224907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 734 aa  172  2e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  25.71 
 
 		 771 aa  172  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.96 
 
 		 728 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 730 aa  171  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 730 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 724 aa  171  6e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 794 aa  171  6e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 780 aa  170  9e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 780 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.17 
 
 		 715 aa  169  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 773 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 732 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  25.13 
 
 		 741 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  25.89 
 
 		 808 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 748 aa  167  5.9999999999999996e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 903 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 817 aa  166  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 726 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 774 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 762 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0681  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 690 aa  164  7e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2522  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 700 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  26.57 
 
 		 754 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  23.97 
 
 		 731 aa  162  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 713 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  27.09 
 
 		 776 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 717 aa  162  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 695 aa  160  6e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  23.85 
 
 		 774 aa  160  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0750  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 690 aa  160  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.921398  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3538  TonB-dependent receptor  24.83 
 
 		 771 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25784  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  26.15 
 
 		 751 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 779 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>