More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3758 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4804  TonB-dependent receptor  56.39 
 
 		 773 aa  827    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.176822  normal  0.517997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3758  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 767 aa  1563    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.626762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 730 aa  346  7e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  35.49 
 
 		 743 aa  345  1e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  31.53 
 
 		 782 aa  320  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  34.58 
 
 		 733 aa  319  1e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 779 aa  286  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  32.9 
 
 		 759 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0899  TonB-dependent receptor  30.26 
 
 		 764 aa  279  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00548484  normal  0.114309 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  31.61 
 
 		 761 aa  273  8.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0155  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 		 774 aa  270  5e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0214646  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00767  TonB-dependent receptor  30.63 
 
 		 772 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  31.18 
 
 		 763 aa  261  4e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 771 aa  256  8e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 737 aa  256  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 		 746 aa  252  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 758 aa  251  4e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 744 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3816  TonB-dependent receptor, plug  29.99 
 
 		 789 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.540841  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 726 aa  242  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 790 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4214  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 726 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.760297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2601  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 789 aa  232  2e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 722 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 755 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 747 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  29.84 
 
 		 725 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4358  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 756 aa  227  6e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 792 aa  226  9e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  29.09 
 
 		 790 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 764 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 755 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1691  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 743 aa  221  6e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0224052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 780 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 704 aa  219  2e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 783 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 730 aa  217  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 807 aa  214  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 758 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 710 aa  214  7e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 741 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 724 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 780 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 775 aa  211  4e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 		 730 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 751 aa  208  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  28.26 
 
 		 803 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4332  TonB-dependent receptor  30.52 
 
 		 779 aa  205  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 		 794 aa  205  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  29.35 
 
 		 776 aa  205  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.97 
 
 		 729 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 722 aa  204  5e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 766 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.2 
 
 		 739 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 807 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 771 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  26.37 
 
 		 765 aa  200  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  27.55 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  27.12 
 
 		 822 aa  200  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 749 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 790 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 731 aa  199  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3243  TonB-dependent receptor  27.55 
 
 		 785 aa  197  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.738407 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0924  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 795 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1360  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 810 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1672  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 761 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.295189  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 723 aa  194  6e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01003  TonB-dependent receptor  28.24 
 
 		 758 aa  194  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000984291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 759 aa  193  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 761 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4129  TonB-dependent receptor  27.58 
 
 		 767 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.108935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3785  TonB-dependent receptor  27.86 
 
 		 748 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1169  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 809 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.149635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.92 
 
 		 717 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2248  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 777 aa  191  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.355949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27.34 
 
 		 785 aa  190  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 773 aa  190  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.52 
 
 		 775 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 796 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  27.17 
 
 		 758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2764  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 776 aa  186  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.700663 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0779  TonB-dependent receptor  27.67 
 
 		 757 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.756258  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.37 
 
 		 735 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 784 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0027  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 754 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.634145  normal  0.0299657 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 786 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  27.32 
 
 		 769 aa  184  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 808 aa  183  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0429  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 738 aa  183  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.77 
 
 		 809 aa  183  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2057  TonB-dependent receptor  27.22 
 
 		 728 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.904465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 720 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 730 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3403  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 731 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.181941  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 764 aa  181  5.999999999999999e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3715  TonB-dependent receptor  27.57 
 
 		 731 aa  180  7e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 803 aa  181  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 753 aa  180  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 732 aa  180  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>