More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3091 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 779 aa  1589    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  41.84 
 
 		 775 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 776 aa  386  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1859  TonB-dependent receptor, plug  35.22 
 
 		 776 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  34.64 
 
 		 780 aa  355  2e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 769 aa  314  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 783 aa  286  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  29.17 
 
 		 803 aa  270  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  29.62 
 
 		 730 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 843 aa  247  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0667  putative TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 793 aa  243  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  30.12 
 
 		 739 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  29.52 
 
 		 704 aa  237  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  28.45 
 
 		 840 aa  237  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 720 aa  228  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  29.44 
 
 		 743 aa  223  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 824 aa  223  9.999999999999999e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 764 aa  221  3.9999999999999997e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 732 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 722 aa  220  7.999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 749 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 741 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 784 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3103  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 725 aa  211  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 722 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 765 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 771 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 747 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 730 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  27.88 
 
 		 864 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 763 aa  201  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 777 aa  201  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 757 aa  201  6e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 775 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  28.28 
 
 		 751 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  27.92 
 
 		 767 aa  197  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3870  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 726 aa  197  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.472213  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  29.21 
 
 		 764 aa  197  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 903 aa  197  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.5 
 
 		 758 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 803 aa  195  3e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  27.25 
 
 		 787 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  26.97 
 
 		 755 aa  194  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 788 aa  193  8e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  29.53 
 
 		 784 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  27.65 
 
 		 735 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 729 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.37 
 
 		 753 aa  192  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 713 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 780 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 723 aa  191  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  28.31 
 
 		 764 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 744 aa  191  5.999999999999999e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 790 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1676  TonB-dependent receptor  27.14 
 
 		 759 aa  188  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4608  TonB-dependent receptor  26.83 
 
 		 771 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.670183  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0760  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 746 aa  188  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 778 aa  188  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 803 aa  187  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  27.35 
 
 		 710 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0235  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 778 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 724 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 794 aa  186  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  28.29 
 
 		 713 aa  185  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  27.47 
 
 		 755 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4474  TonB-dependent receptor  25.99 
 
 		 855 aa  185  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.18025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 769 aa  184  4.0000000000000006e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1664  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 797 aa  184  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  26.5 
 
 		 761 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0563  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 737 aa  182  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.354996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 734 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2843  TonB-dependent receptor  26.19 
 
 		 780 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  26.47 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.72 
 
 		 755 aa  181  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0216  TonB-dependent receptor  27.4 
 
 		 786 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4140  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 733 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  26.95 
 
 		 745 aa  180  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  26.07 
 
 		 730 aa  180  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0680  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 753 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.915685  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 		 783 aa  179  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 808 aa  178  3e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1022  TonB-dependent receptor  26.39 
 
 		 717 aa  178  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.549497  normal  0.0859542 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 792 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1115  TonB-dependent receptor, plug  26.34 
 
 		 839 aa  177  9.999999999999999e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.339476  normal  0.267741 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.18 
 
 		 790 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 797 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1559  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.224366  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0429  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 687 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.395875  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  27.23 
 
 		 755 aa  174  7.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2509  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 796 aa  173  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0838  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 784 aa  173  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.543074 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  26.05 
 
 		 838 aa  173  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  25.37 
 
 		 715 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1573  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 796 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  26.28 
 
 		 762 aa  173  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0516  TonB-dependent receptor  26.62 
 
 		 773 aa  172  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.756879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1982  TonB-dependent receptor, plug  27.71 
 
 		 809 aa  172  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2447  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 783 aa  171  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 766 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>