More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3508 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2469  TonB-dependent receptor  52.76 
 
 		 843 aa  815    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3469  TonB-dependent receptor  55.74 
 
 		 824 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3508  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 840 aa  1727    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1889  TonB-dependent receptor  33.97 
 
 		 817 aa  360  6e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1010  TonB-dependent receptor  30.28 
 
 		 769 aa  289  2e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247668  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4330  TonB-dependent receptor  29.94 
 
 		 780 aa  283  8.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.971491 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3044  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 775 aa  250  8e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000826445  unclonable  0.00000113602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3091  TonB-dependent receptor  27.93 
 
 		 779 aa  230  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0504  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 777 aa  229  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4231  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 776 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 720 aa  224  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4555  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 803 aa  214  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00333953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 758 aa  211  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2576  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 783 aa  211  4e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.333669  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3668  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 757 aa  203  9e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.859497  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  27.73 
 
 		 780 aa  203  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  26.51 
 
 		 755 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 745 aa  197  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  26.43 
 
 		 730 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 741 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0895  TonB-dependent receptor  26.78 
 
 		 769 aa  196  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0618302  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  26.2 
 
 		 704 aa  191  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.1 
 
 		 743 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  25.47 
 
 		 722 aa  191  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  26.7 
 
 		 739 aa  190  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3395  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 713 aa  189  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000531057  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  26.23 
 
 		 803 aa  189  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1583  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 724 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.06 
 
 		 766 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 808 aa  185  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2351  TonB-dependent receptor  26.3 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.639687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 761 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0484  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 723 aa  184  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2264  TonB-dependent receptor  25.66 
 
 		 825 aa  183  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.249992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4179  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 782 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.130492 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3562  TonB-dependent receptor, plug  25.54 
 
 		 747 aa  182  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000379624  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2458  TonB-dependent receptor  26.93 
 
 		 758 aa  181  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0905  TonB-dependent receptor, plug  26.68 
 
 		 748 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000091536  normal  0.106879 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5277  TonB-dependent receptor  25.5 
 
 		 755 aa  180  8e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 734 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 710 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  24.94 
 
 		 744 aa  179  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 729 aa  179  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 764 aa  177  7e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1985  TonB-dependent receptor, plug  25.69 
 
 		 754 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3048  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 790 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 790 aa  177  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1539  TonB-dependent receptor  25.35 
 
 		 735 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000217846  hitchhiker  0.00247373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2240  TonB-dependent siderophore receptor  26.31 
 
 		 695 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4350  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 743 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.425667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  25.98 
 
 		 763 aa  174  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 792 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  26.04 
 
 		 726 aa  174  9e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  25.65 
 
 		 761 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2471  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 732 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 749 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 733 aa  173  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 771 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 730 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4151  TonB-dependent receptor  26.61 
 
 		 764 aa  171  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394779  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0872  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 800 aa  171  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00643359  normal  0.114745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1016  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 800 aa  171  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0377724  normal  0.0225916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6222  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 797 aa  170  9e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  27.42 
 
 		 775 aa  170  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3029  TonB-dependent receptor  24.5 
 
 		 919 aa  169  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.709462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 736 aa  170  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  24.3 
 
 		 808 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  26.25 
 
 		 728 aa  169  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2319  TonB-dependent receptor  24.33 
 
 		 765 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000203975  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  26.9 
 
 		 780 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 747 aa  167  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  25.23 
 
 		 780 aa  167  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  24.83 
 
 		 715 aa  165  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2517  TonB-dependent receptor  24.04 
 
 		 809 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  27.53 
 
 		 751 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08200  TonB-dependent siderophore receptor  24.76 
 
 		 767 aa  164  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0454  TonB-dependent receptor  24.28 
 
 		 807 aa  164  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000000638696  n/a   
 
 
 
NC_010333  Caul_5396  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 838 aa  164  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0981  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 807 aa  163  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1671  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 732 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  25.52 
 
 		 794 aa  160  6e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  24.12 
 
 		 796 aa  160  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_008347  Mmar10_0315  TonB-dependent receptor  26.49 
 
 		 770 aa  159  2e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00000163095  decreased coverage  0.00695956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1702  TonB-dependent receptor  25.18 
 
 		 788 aa  159  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0806074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4338  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 		 864 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438628  normal  0.924042 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3778  TonB-dependent receptor  24.37 
 
 		 822 aa  157  6e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 779 aa  157  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 789 aa  157  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  26.32 
 
 		 790 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1534  TonB-dependent receptor  24.87 
 
 		 771 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4781  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.211672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 790 aa  154  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 803 aa  154  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 765 aa  152  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0505  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 713 aa  152  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.742507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2541  TonB-dependent receptor  28.98 
 
 		 896 aa  152  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.411805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5001  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 778 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0280041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0178  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 841 aa  152  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 730 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>